論文の概要: A Digital Pathology Resource for Liver Cancer Quantification with Datasets, Benchmarks, and Tools
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.22858v1
- Date: Wed, 22 Apr 2026 14:13:09 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-28 17:12:07.001887
- Title: A Digital Pathology Resource for Liver Cancer Quantification with Datasets, Benchmarks, and Tools
- Title(参考訳): データセット・ベンチマーク・ツールを用いた肝癌定量化のためのデジタル病理資源
- Authors: Ying Xiao, Shimiao Tang, Xitong Ling, Weiming Chen, Jun Wang, Jiawen Li, Huaitian Yuan, Jianghui Yang, Bowen Li, Huan Li, Yiting Meng, Tian Guan, Yonghong He, Hongfang Yin,
- Abstract要約: 肝癌に対するパッチレベルの画像データベースであるHepatoBenchを7つの主要組織カテゴリにアノテーションでリリースした。
HepatoBenchに基づいて、組織認識ツールとしてディープラーニング分類モデルをトレーニングし、オープンソース化する。
We build HepatoQuant, a end-to-end, disease-specific Regional Quantification tools for liver cancer。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 17.811013755898365
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Liver cancer, especially hepatocellular carcinoma (HCC), imposes a substantial global disease burden. Accurate diagnosis and prognostic assessment directly influence treatment selection and patient survival, and pathological examination remains the gold standard for liver cancer diagnosis. Identifying diverse tissue components and pathological subtypes on histopathology slides is crucial for estimating postoperative recurrence risk and overall prognosis. However, most publicly available resources are still provided at the whole-slide image (WSI) level, and well-annotated datasets for fine-grained tissue component identification in liver cancer are scarce, which hinders reproducible model development and the deployment of quantitative analysis tools. To address this gap, we release HepatoBench, a patch-level image database for liver cancer with annotations for seven key tissue categories. Based on HepatoBench, we train and open-source a deep learning classification model as a tissue recognition tool. Furthermore, we train a WSI-level tumor/non-tumor segmentation model to automatically localize lesion regions across entire slides. By integrating the patch-level tissue classifier with the WSI-level segmentation model, we build HepatoQuant, an end-to-end, disease-specific regional quantification tool for liver cancer, enabling a unified workflow from WSIs to tissue composition parsing and quantitative statistics. We also open-source HepatoBench, the benchmarking protocol, and supporting tools, providing a solid foundation for automated regional quantification and fair method comparison in liver cancer pathology.
- Abstract(参考訳): 肝癌、特に肝細胞癌(HCC)は、世界的な疾病の重荷を負う。
正確な診断と予後評価は治療選択と患者生存に直接影響を及ぼし,病理検査は肝癌診断のゴールドスタンダードのままである。
病理組織学的スライスにおける組織成分および病理学的サブタイプ同定は術後再発リスクと全体的な予後を推定するために重要である。
しかしながら、ほとんどの公開リソースは、依然として全スライディング画像(WSI)レベルで提供されており、肝臓がんにおける微細組織成分の同定のための十分な注釈付きデータセットは乏しく、再現可能なモデル開発や定量的解析ツールの展開を妨げる。
このギャップに対処するため,肝癌用のパッチレベルの画像データベースであるHepatoBenchを7つの重要な組織カテゴリのアノテーションでリリースした。
HepatoBenchに基づいて、組織認識ツールとしてディープラーニング分類モデルをトレーニングし、オープンソース化する。
さらに,WSIレベルの腫瘍/非腫瘍セグメンテーションモデルをトレーニングし,スライド全体にわたって病変領域を自動的に局在させる。
パッチレベルの組織分類器をWSIレベルのセグメンテーションモデルと組み合わせることで、肝がんのエンドツーエンドで疾患特異的な領域定量化ツールであるHepatoQuantを構築し、WSIから組織組成解析、定量的統計までの統合ワークフローを可能にする。
我々はまた、ベンチマークプロトコルであるHepatoBenchをオープンソースとして公開し、肝癌病理における局所的自動定量化と公正な方法比較のための確かな基盤を提供する。
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