論文の概要: All-atomistic Transferable Neural Potentials for Protein Solvation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.14584v1
- Date: Thu, 14 May 2026 08:54:41 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-15 21:45:34.7349
- Title: All-atomistic Transferable Neural Potentials for Protein Solvation
- Title(参考訳): タンパク質溶解のための全原子移動型神経電位
- Authors: Rishabh Dey, Salvina Sharipova, Konstantin Popov,
- Abstract要約: 入射溶媒モデル(英語版)は、溶媒の自由度を減少させ、水分子を含まない溶媒エネルギーの計算を可能にするために広く用いられている。
近年の神経電位の進歩は薬物発見の可能性を示唆しているが、伝達性は持続的な課題である。
本稿では,最終エネルギーにポストホック調整を適用するのではなく,モデルパラメータへの変換可能な補正を学習することにより,解析的連続解法を拡張する暗黙の解法モデルであるPhitary Hydration Neural Network(PHNN)を紹介する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Implicit solvent models are widely used to decrease the number of solvent degrees of freedom and enable the calculation of solvation energetics without water molecules. However, its accuracy often falls short compared to explicit models. Recent advancements in neural potentials have shown promise in drug discovery, but transferability remains a persistent challenge. Here, we introduce the Protein Hydration Neural Network (PHNN), an implicit solvent model that extends analytical continuum solvation by learning transferable corrections to model parameters instead of applying post hoc adjustments to final energies. The model is explicitly designed to maximize data efficiency by leveraging physical priors embedded in the data. We demonstrate that PHNN improves accuracy relative to traditional analytical methods and maintains predictive accuracy on out-of-domain protein systems.
- Abstract(参考訳): 入射溶媒モデル(英語版)は、溶媒の自由度を減少させ、水分子を含まない溶媒エネルギーの計算を可能にするために広く用いられている。
しかし、その精度は明示的なモデルに比べて低い場合が多い。
神経電位の最近の進歩は、薬物発見の公約を示しているが、伝達性は持続的な課題である。
本稿では,最終エネルギーにポストホック調整を適用するのではなく,モデルパラメータへの変換可能な補正を学習することにより,解析的連続解法を拡張する暗黙の解法モデルであるPhitary Hydration Neural Network(PHNN)を紹介する。
このモデルは、データに埋め込まれた物理的事前情報を活用することにより、データの効率を最大化するように設計されている。
我々は、PHNNが従来の分析手法と比較して精度を向上し、ドメイン外タンパク質系の予測精度を維持することを実証した。
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