論文の概要: fMRI-Diffusion: Generating fMRI Time Series Via a Temporal Transformer Diffusion Model for Major Depressive Disorder Diagnosis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.24065v1
- Date: Fri, 22 May 2026 04:47:18 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-26 19:50:17.57144
- Title: fMRI-Diffusion: Generating fMRI Time Series Via a Temporal Transformer Diffusion Model for Major Depressive Disorder Diagnosis
- Title(参考訳): fMRI拡散:大うつ病診断のための経時的変圧器拡散モデルを用いたfMRI時系列生成
- Authors: Muhammad Asif Hasan, Yanming Zhu, Xuefei Yin, Alan Wee-Chung Liew,
- Abstract要約: 機能的磁気共鳴画像(fMRI)からMDD(Major Depressive Disorder)を診断するには、臨床環境では不十分な大量のラベル付きデータが必要である。
本稿では,FC行列ではなく,関心領域(ROI)レベルのfMRI時系列を合成するフレームワークであるfMRI-Diffusionを提案する。
テンポラルトランスフォーマーは、分極拡散確率モデル内の分極ネットワークとして機能し、各時点をトークンとして扱い、自己注意を通して時間的依存関係をキャプチャする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.96995835279229
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Diagnosing Major Depressive Disorder (MDD) from functional magnetic resonance imaging (fMRI) using functional connectivity (FC) analysis requires large amounts of labeled data that are scarce in clinical settings. Existing augmentation methods synthesize FC matrices, which compress fMRI recordings into static pairwise summaries and discard temporal information. We propose fMRI-Diffusion, a framework that synthesizes region-of-interest (ROI)-level fMRI time series rather than FC matrices. A Temporal Transformer serves as the denoising network within a denoising diffusion probabilistic model, treating each time point as a token to capture temporal dependencies through self-attention. A supervised pretraining strategy initializes the Transformer with task-relevant representations before diffusion training, and FC matrices are derived from the synthesized time series for classification. Experiments on the REST-meta-MDD dataset show that augmenting training data with synthetic time series consistently improves diagnostic accuracy across ten classifiers, six parcellation atlases, and three acquisition sites. The method outperforms five recent FC-based synthesis approaches, with accuracy gains of up to 3.7 percentage points over the strongest baseline. Ablation studies confirm the contributions of both the Transformer-based denoiser and the pretraining strategy. Distributional fidelity metrics remain below 0.06 across all conditions, indicating close agreement between real and synthetic distributions. These findings suggest that synthesizing fMRI time series before FC computation preserves temporal information lost in matrix-level augmentation and provides a practical strategy for MDD diagnosis under limited data.
- Abstract(参考訳): 機能的磁気共鳴画像(fMRI)を用いた大うつ病 (MDD) の診断には, 臨床症状に乏しい大量のラベル付きデータが必要である。
既存の拡張法はFC行列を合成し、fMRI記録を静的な一対の要約に圧縮し、時間情報を破棄する。
本稿では,FC行列ではなく,関心領域(ROI)レベルのfMRI時系列を合成するフレームワークであるfMRI-Diffusionを提案する。
テンポラルトランスフォーマーは、分極拡散確率モデル内の分極ネットワークとして機能し、各時点をトークンとして扱い、自己注意を通して時間的依存関係をキャプチャする。
教師付き事前学習戦略では、拡散訓練の前にタスク関連表現でトランスフォーマーを初期化し、合成時系列からFC行列を抽出して分類する。
REST-meta-MDDデータセットの実験によると、合成時系列によるトレーニングデータの拡張は、10の分類器、6つのパーセレーションアトラス、3つの取得サイトにわたる診断精度を一貫して改善する。
この手法は最近の5つのFCベースの合成手法より優れており、最強のベースラインで最大3.7%の精度向上を達成している。
アブレーション研究はトランスフォーマーベースのデノイザーと事前学習戦略の両方の貢献を確認している。
分布の忠実度は全ての条件で0.06以下であり、実際の分布と合成分布の密接な一致を示している。
これらの結果から,FC計算前のfMRI時系列の合成は,行列レベルの拡張で失われる時間情報を保存し,限られたデータによるMDD診断の実践的戦略をもたらすことが示唆された。
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