論文の概要: Deep Learning for Generating Computational PIN-4 Immunohistochemistry Staining from Prostate Biopsy H&E Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.01871v1
- Date: Mon, 01 Jun 2026 08:19:25 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-03 00:57:58.946594
- Title: Deep Learning for Generating Computational PIN-4 Immunohistochemistry Staining from Prostate Biopsy H&E Images
- Title(参考訳): 前立腺生検H&E画像を用いたPIN-4免疫組織化学の深層学習
- Authors: Vietbao Tran, Pratik Shah,
- Abstract要約: PIN-4染色は通常、ヘマトキシリンとエオシン(H&E)染色組織の隣接組織で行われる。
正常な臨床前立腺生検画像からH&E/PIN-4データセットを合成した。
ネイティブH&E画像パッチから直接PIN-4染色パターンを合成するために,条件付き生成対向ネットワーク(cGAN)を訓練した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Immunohistochemistry (IHC)is frequently used to resolve diagnostically ambiguous prostate cancer biopsy findings on hematoxylin and eosin (H&E)-stained tissue. However, PIN-4 IHC staining is typically performed on adjacent tissue sections, limiting direct spatial comparison between the H&E morphology and the corresponding immunophenotypic signal. A paired, registered H&E/PIN-4 dataset was constructed from routine clinical prostate biopsy whole-slide images (WSIs), and a conditional generative adversarial network (cGAN) was trained to synthesize PIN-4 staining patterns directly from native H&E image patches. The final dataset comprised 172 paired WSIs from 93 patients and 27,298 registered 1024x1024 patch pairs, spanning adenocarcinoma-positive and benign cases with representation across age, race, and ethnicity groups. The model was evaluated on a held-out test set of 1,814 patch pairs from 17 WSIs, achieving a mean peak signal-to-noise ratio (PSNR) of 21.88 dB, structural similarity index measure (SSIM) of 0.667, Pearson correlation coefficient (PCC) of 0.684, and learned perceptual image patch similarity (LPIPS) of 0.417. Qualitative review by a board-certified pathologist showed that generated images captured diagnostically relevant PIN-4 staining patterns, including AMACR/racemase expression and basal-cell-associated staining, while preserving spatial correspondence with the source H&E morphology. Accuracy of synthesis varied across morphologically complex regions, including high-grade carcinoma and intraductal carcinoma. These results support the feasibility of supervised PIN-4 synthesis from routinely acquired brightfield H&E prostate biopsy images. The approach enables direct interpretation of predicted PIN-4 marker patterns in the context of the source prostate H&E architecture, addressing a current spatial limitation of conventional adjacent-section IHC.
- Abstract(参考訳): 免疫組織化学(IHC)は、ヘマトキシリンおよびエオシン(H&E)染色組織における診断学的に曖昧な前立腺癌生検所見を解決するために頻繁に用いられる。
しかし、PIN-4 IHC染色は通常、隣接する組織部位で行われ、H&E形態とそれに対応する免疫フェノタイプ信号との直接空間的比較が制限される。
The paired, registered H&E/PIN-4 dataset was constructed from routine clinical prostate biopsy whole-slide images (WSIs) and a conditional generative adversarial network (cGAN) was trained to synthesis PIN-4 staining pattern from native H&E image patch。
最終データセットは、93人の患者172組のWSIと、27,298人が登録した1024×1024のパッチペアからなり、年齢、人種、民族に代表される腺癌陽性および良性症例にまたがった。
モデルは,17 WSIの1,814個のパッチペアを用いて,21.88dBの平均ピーク信号-雑音比(PSNR),0.667のSSIM,0.684のPearson相関係数(PCC),0.417のLPIPSを学習した。
AMACR/racemase発現や基底細胞関連染色など,診断に関連のあるPIN-4染色パターンを撮像した画像が得られたが,H&E形態との空間的対応は保たれた。
合成の精度は, 高次癌, 管内癌など, 形態学的に複雑な領域で異なっていた。
これらの結果は、日常的に取得された明るいH&E前立腺生検画像からの教師付きPIN-4合成の実現性を支持する。
この手法により、従来の隣接区間IHCの空間制限に対処するため、ソース前立腺H&Eアーキテクチャの文脈で予測されたPIN-4マーカーパターンを直接解釈できる。
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