論文の概要: Latent Structural Categorical Matrix Completion with Application to Quasispecies Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.08188v1
- Date: Sat, 06 Jun 2026 14:19:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-09 14:42:05.899115
- Title: Latent Structural Categorical Matrix Completion with Application to Quasispecies Analysis
- Title(参考訳): 後期構造分類行列の完全化と準種解析への応用
- Authors: Qian Zhang, Meixia Lin,
- Abstract要約: 行列補完は実数値データに対して広く研究されてきたが、既存の手法は分類変数を扱う場合に限られることが多い。
潜在因数分解による分類行列補完のための二重ループ最適化フレームワークLCMCを提案する。
ウイルスの準種再構成における合成および実世界のデータセットの実験は、LCMCが既存の方法よりも精度と効率が優れていることを実証している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.2807574173968774
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Matrix completion has been extensively studied for real-valued data, but existing methods are often limited in handling categorical variables. We propose LCMC, a double-loop optimization framework for categorical matrix completion via latent factorization based on a binary tensor representation. In this setting, each categorical entry is encoded as a one-hot vector along a third tensor mode, thereby preserving its discrete, non-ordinal nature. The outer loop adaptively estimates the latent dimension by iteratively updating it with feedback from the inner loop, while the inner loop reconstructs the categorical matrix through tensor factorization, supported by a corresponding theoretical analysis. To further improve scalability and robustness, we introduce enhancements including a split-merge-refine strategy and an adaptive data reduction technique. Experiments on synthetic and real-world datasets in viral quasispecies reconstruction, demonstrate that LCMC achieves superior accuracy and efficiency compared to existing methods.
- Abstract(参考訳): 行列補完は実数値データに対して広く研究されてきたが、既存の手法は分類変数を扱う場合に限られることが多い。
本稿では,2進テンソル表現に基づく潜在因数分解による分類行列補完のための2ループ最適化フレームワークLCMCを提案する。
この設定では、各カテゴリのエントリは第3テンソルモードに沿って1ホットベクトルとして符号化され、したがってその離散非順序性を保存する。
外ループは内ループからのフィードバックで反復的に更新することで潜伏次元を適応的に推定し、内ループは対応する理論的解析によって支持されるテンソル因子化によってカテゴリー行列を再構成する。
スケーラビリティとロバスト性をさらに向上するため,分割マージ・リファイン戦略と適応型データリダクション技術を含む拡張を導入する。
ウイルスの準種再構成における合成および実世界のデータセットの実験は、LCMCが既存の方法よりも精度と効率が優れていることを実証している。
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