論文の概要: Multi-Modal Spatio-Temporal Graph Neural Network with Mixture of Experts for Soil Organic Carbon Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.16580v1
- Date: Mon, 15 Jun 2026 11:25:38 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-16 16:21:34.483209
- Title: Multi-Modal Spatio-Temporal Graph Neural Network with Mixture of Experts for Soil Organic Carbon Prediction
- Title(参考訳): 土壌有機炭素予測の専門家の混在を考慮した多モード時空間グラフニューラルネットワーク
- Authors: Daniele Mos, Felipe Drummond, Anton Bossenbroek, Soufiane el Khinifri,
- Abstract要約: 既存のアプローチでは、手作りのコモーダルを古典的なMLとペアリングするか、豊富なスペクトルと時間情報を見逃す単一モードのディープモデルである。
本稿では,SpTGNNとグリッドベースアーキテクチャの両方に対処するマルチテンポラルグラフニューラルネットワークであるSpTG-NNを紹介する。
微調整されたTerraMindエンコーダは、Sentinel-2、Sentinel-1、DEM信号からノード特徴を抽出する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Top-soil organic carbon (SOC) prediction is fundamental to agricultural sustainability, land use policy and fertilization planning. Existing approaches face two limitations: they pair hand-crafted covariates with classical ML or single-modal deep models that miss rich spectral and temporal information, and grid-based architectures ignore the irregular spatial structure of field measurements. We introduce SpTGNN, a multi-modal spatio-temporal graph neural network addressing both. SpTGNN represents soil measurements as nodes in a heterogeneous graph with three edge types (spatial proximity, spectral similarity, elevation), and applies relational graph attention to learn separate patterns per relation. A fine-tuned TerraMind encoder extracts node features from Sentinel-2, Sentinel-1 and DEM signals, combined with per-sample environmental covariates and learned positional and temporal embeddings. A sparse Mixture-of-Experts module fuses the four streams via top-$k$ routing. Uncertainty is captured by pairing heteroscedastic regression (aleatoric) with deep ensembles (epistemic), and a Moran's $I$ penalty regularizes spatial autocorrelation. We evaluate on a global SOC corpus split into three regional instances ($\sim$49k samples globally, Africa $\sim$26k, Europe $\sim$14k). Our 5-member deep ensemble reports $R^2=0.762$, RMSE $=3.51\pm0.48$ g/kg and MAPE $=22.9\%$ on the Africa test split, improving over a tabular XGBoost baseline; the best single checkpoint reaches validation $R^2=0.864$. Ablations confirm the heterogeneous graph, MoE fusion and fine-tuned backbone each contribute substantively, and the ensemble UQ stack achieves post-calibration ECE of $0.031$ (hybrid) and $0.026$ ($β$-NLL). To our knowledge, this is the first framework to unify foundation-model feature extraction, heterogeneous graph attention and decomposed uncertainty quantification for SOC estimation.
- Abstract(参考訳): トップ土壌有機炭素(SOC)予測は、農業の持続可能性、土地利用政策、肥料化計画の基礎となる。
既存のアプローチは、2つの制限に直面している:それらは手作りの共変体と古典的なMLまたは豊富なスペクトルや時間的情報を欠く単一モードのディープモデルとをペアリングし、グリッドベースのアーキテクチャはフィールド測定の不規則な空間構造を無視している。
本稿では,マルチモーダル時空間グラフニューラルネットワークSpTGNNを紹介する。
SpTGNNは3つのエッジタイプ(空間的近接性、スペクトル類似性、標高)を持つ不均一グラフのノードとして土壌測定を表現し、関係関係ごとに異なるパターンを学習するために関係グラフの注意を適用する。
微調整されたTerraMindエンコーダは、Sentinel-2、Sentinel-1、DEM信号からノード特徴を抽出し、サンプルごとの環境共変と位置および時間埋め込みを学習する。
スパースMixture-of-Expertsモジュールは、トップ$k$ルーティングを介して4つのストリームを融合する。
不確実性は、深いアンサンブルとヘテロスセダスティック回帰(アラート性)をペアリングすることによって捉えられ、モランのI$ペナルティは空間的自己相関を規則化する。
グローバルなSOCコーパスを3つの地域インスタンス(グローバルに$49k、アフリカに$26k、ヨーロッパに$14k)に分けて評価する。
我々の5員のディープアンサンブルは、$R^2=0.762$, RMSE $=3.51\pm0.48$ g/kg, MAPE $=22.9\%$をアフリカのテストスプリットで行い、表のXGBoostベースラインよりも改善した。
アブレーションにより不均一グラフ、MoE融合、微調整バックボーンはそれぞれ実質的に寄与し、アンサンブルUQスタックは0.031$(ハイブリド)および0.026$(β$-NLL)のポスト校正ECEを達成する。
我々の知る限り、これは基礎モデルの特徴抽出、異種グラフの注意、SOC推定のための不確実性定量化を統一する最初のフレームワークである。
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