論文の概要: Recovering Candidate Circadian Regulators of Arrhythmic Pituitary Hormone Genes Using Reliability-Weighted Magnetic Laplacian with rwMagLap

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2607.06579v1
• Date: Fri, 03 Jul 2026 01:37:59 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2026-07-09 22:50:30.138553
• Title: Recovering Candidate Circadian Regulators of Arrhythmic Pituitary Hormone Genes Using Reliability-Weighted Magnetic Laplacian with rwMagLap
• Title（参考訳）: rwMagLapを用いた磁気ラプラシアンを用いた不整脈性下垂体ホルモン遺伝子のカジュアルレギュレータの回収
• Authors: Shabnam Sodagari, Nick Jasperson,
• Abstract要約: 女性の健康に重要な下垂体ホルモン遺伝子を概日周期で検索する方法について検討した。 我々は,リズミカルバックボーン遺伝子のグラフを作成するtextbfrwMagLapを提案する。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.0
• License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
• Abstract: We study how to recover candidate circadian-clock regulators of pituitary hormone genes that are important for women's health but do not show a clear 24-hour rhythm in bulk tissue, aiming to nominate clock-linked regulatory targets that could inform future chronopharmacologic and chronotherapeutic strategies. We propose \textbf{rwMagLap}, which builds a graph on rhythmic backbone genes. For each edge, we combine 24-hour fit quality with peak-time phase, represented as a complex unit-circle value, yielding a Hermitian adjacency matrix and a magnetic Laplacian. We insert arrhythmic hormone genes, treated as anchors, by a reliability-weighted nearest-neighbor projection. The projected anchor-neighbor weights are pooled into a soft teleport distribution, and complex personalized PageRank then ranks rhythmic backbone genes by the magnitude of their PageRank scores. In pituitary data, we find that all 11 women's-health anchors are arrhythmic. Even so, we find that the top-50 list is $7.95\times$ enriched for the 13-gene KEGG circadian set (7 of the 8 set genes in the 454-gene backbone; corrected Benjamini-Hochberg (BH) $p_{\mathrm{BH}}=4\times10^{-6}$) and $4.54\times$ enriched for the 111-gene Reactome set (8 of 16 genes; $p_{\mathrm{BH}}=1.6\times10^{-4}$), while a phase-blind real-valued baseline recovers none. We recover candidates through reliability weighting and phase-aware seeding rather than through magnetic propagation. The magnetic phase adds a different capability: it represents temporal order. On pituitary backbone, the magnetic embedding recovers measured peak-time order of connected pituitary genes with accuracy $0.971$, while $q{=}0$, i.e., no magnetic charge, is at chance.
• Abstract（参考訳）: 本研究は,女性の健康に重要な下垂体ホルモン遺伝子を概日周期で調節する方法について検討した。 そこで我々は,リズミカルバックボーン遺伝子にグラフを付加した \textbf{rwMagLap} を提案する。 各エッジに対して、24時間適合品質とピーク時位相を合成し、複雑な単位円の値として表現し、エルミート隣接行列と磁気ラプラシアンを生成する。 アンカーとして扱われる不整脈ホルモン遺伝子を,信頼性に富んだ近傍投射により挿入する。 そして複雑なパーソナライズされたPageRankは、彼らのPageRankスコアの大きさでリズミカルなバックボーン遺伝子をランク付けします。 下垂体データでは、11人の女性の健康なアンカーはすべて不整脈である。 それでもトップ50リストは、13遺伝子KEGG概日基集合(454遺伝子バックボーンの8セットの7つのうち7つ、Benjamini-Hochberg (BH) $p_{\mathrm{BH}}=4\times10^{-6}$)に対して7.95\times$、11遺伝子Reactome集合(16遺伝子のうち8つ、$p_{\mathrm{BH}}=1.6\times10^{-4}$)に対して4.54\times$enrichedされている。 磁気伝搬ではなく、信頼性重み付けと位相認識シードにより候補を復元する。 磁気相は異なる能力、すなわち時間秩序を表わす。 下垂体後骨では、磁気埋め込みは接続された下垂体遺伝子のピーク時オーダーを精度0.971$で回収するが、$q{=}0$、すなわち磁気電荷は存在しない。

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