論文の概要: Neural ODE enhanced linear mixed effect models for estimating complex association patterns of time-varying covariates with the marker trajectory
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.29714v1
- Date: Sun, 30 Aug 2026 10:45:02 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-01 18:31:31.051118
- Title: Neural ODE enhanced linear mixed effect models for estimating complex association patterns of time-varying covariates with the marker trajectory
- Title(参考訳): 時間変化共変量とマーカー軌道との複雑な関連パターン推定のためのニューラルODE強化線形混合効果モデル
- Abstract要約: 本稿では,線形混合効果フレームワークにニューラル正規微分方程式(Neural Ordinary Differential Equation,Neural ODE)を組み込むニューラルODE-LMMを提案する。
この方法では、BMIの軌跡依存的な関連と、認知的低下を伴うグルコースの断食が明らかにされる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.3420768233632066
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Longitudinal cohort studies produce repeated data that enable the assessment of time-varying association patterns between exposures and health outcomes. Classical linear mixed-effects models (LMMs) can accommodate a large variety of association patterns while accounting for the irregularly spaced, partially observed measurement. But they require the analyst to pre-specify the functional form linking the exposure history to the outcome. We propose the Neural ODE-LMM, which embeds a Neural Ordinary Differential Equation (Neural ODE) within the linear mixed-effects framework: a learned vector field encodes covariate trajectories into a continuous-time latent state that drives both the fixed- and random-effect design, while preserving the standard LMM observation model. This retains classical likelihood-based inference while learning complex, potentially cumulative, covariate effects flexibly. All parameters are estimated by maximising a penalised marginal likelihood. To quantify covariate effects, we introduce contrasts of counterfactual predictions that compare the expected outcome under alternative covariate trajectories with variance estimated via the delta method. In simulations, the model recovers both instantaneous and cumulative-burden effects without prior specification of the functional form. Applied to the Trois-Cités (3C) cohort, a population-based study of 7{,}324 participants, the method reveals trajectory-dependent associations of BMI and fasting glucose with cognitive decline.
- Abstract(参考訳): 縦断コホート研究は、暴露と健康結果の間の時間変化の関連パターンを評価できる反復的なデータを生成する。
古典線形混合効果モデル(LMM)は、不規則に空間化され、部分的に観察される測定を考慮に入れながら、様々な関連パターンに対応できる。
しかし、それらは、露出履歴と結果とをリンクする機能フォームを事前に指定する必要がある。
本稿では,線形混合効果フレームワークにニューラル正規微分方程式(Neural Ordinary Differential Equation,Neural ODE)を組み込んだニューラルODE-LMMを提案する。
これは古典的な確率に基づく推論を維持し、複雑な、潜在的に累積的、共変量効果を柔軟に学習する。
すべてのパラメータは、ペナル化された限界確率を最大化することによって推定される。
共変量効果を定量化するために, 代替共変量トラジェクトリによる予測結果とデルタ法で推定されるばらつきとを比較する, 反実予測のコントラストを導入する。
シミュレーションでは、モデルが関数形式の事前仕様なしで即時および累積バーデン効果を回復する。
人口ベースの7{,}324人の調査であるTrois-Cités(3C)コホートに適用すると、BMIの軌道依存的な関連と認知低下を伴うグルコースの断食が明らかになる。
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