論文の概要: Transfer Learning for Brain Tumor Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/1912.12452v2
- Date: Thu, 26 Nov 2020 22:12:40 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-17 13:14:36.799328
- Title: Transfer Learning for Brain Tumor Segmentation
- Title(参考訳): 脳腫瘍分離のための転写学習
- Authors: Jonas Wacker, Marcelo Ladeira, Jos\'e Eduardo Vaz Nascimento
- Abstract要約: グリオーマは、化学療法や手術で治療される最も一般的な悪性脳腫瘍である。
近年のディープラーニングの進歩により、様々な視覚認識タスクに優れた畳み込みニューラルネットワークアーキテクチャが実現されている。
本研究では,事前学習した畳み込みエンコーダを用いてFCNを構築し,この方法でトレーニングプロセスを安定させ,ダイススコアやハウスドルフ距離に対する改善を実現することを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.6408773096179187
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Gliomas are the most common malignant brain tumors that are treated with
chemoradiotherapy and surgery. Magnetic Resonance Imaging (MRI) is used by
radiotherapists to manually segment brain lesions and to observe their
development throughout the therapy. The manual image segmentation process is
time-consuming and results tend to vary among different human raters.
Therefore, there is a substantial demand for automatic image segmentation
algorithms that produce a reliable and accurate segmentation of various brain
tissue types. Recent advances in deep learning have led to convolutional neural
network architectures that excel at various visual recognition tasks. They have
been successfully applied to the medical context including medical image
segmentation. In particular, fully convolutional networks (FCNs) such as the
U-Net produce state-of-the-art results in the automatic segmentation of brain
tumors. MRI brain scans are volumetric and exist in various co-registered
modalities that serve as input channels for these FCN architectures. Training
algorithms for brain tumor segmentation on this complex input requires large
amounts of computational resources and is prone to overfitting. In this work,
we construct FCNs with pretrained convolutional encoders. We show that we can
stabilize the training process this way and achieve an improvement with respect
to dice scores and Hausdorff distances. We also test our method on a privately
obtained clinical dataset.
- Abstract(参考訳): グリオーマは、化学療法や手術で治療される最も一般的な悪性脳腫瘍である。
磁気共鳴イメージング(MRI)は、放射線療法士が手動で脳の病変を分類し、治療全体を通してその発達を観察するために用いられる。
手動画像分割プロセスは時間を要するため、結果が人によって異なる傾向がある。
したがって、様々な脳組織タイプの信頼できる正確なセグメンテーションを生成する自動画像セグメンテーションアルゴリズムには、かなりの需要がある。
ディープラーニングの最近の進歩は、様々な視覚認識タスクに優れた畳み込みニューラルネットワークアーキテクチャにつながった。
医学的イメージセグメンテーションを含む医学的文脈への適用が成功している。
特に、U-Netのような完全畳み込みネットワーク(FCN)は、脳腫瘍を自動分割する最先端の結果を生み出している。
MRI脳スキャンは容積的であり、これらのFCNアーキテクチャの入力チャネルとして機能する様々な共登録モダリティに存在する。
この複雑な入力に対する脳腫瘍のセグメンテーションの訓練アルゴリズムは大量の計算資源を必要とし、過度に適合する傾向にある。
本研究では,事前学習した畳み込みエンコーダを用いたFCNを構築する。
この方法でトレーニングプロセスを安定させ,ダイススコアやハウスドルフ距離に関して改善できることを示す。
また, 個人で収集した臨床データを用いて本手法を検証した。
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