論文の概要: Uncertainty quantification in medical image segmentation with
normalizing flows
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2006.02683v2
- Date: Tue, 4 Aug 2020 10:40:10 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-25 08:56:56.922009
- Title: Uncertainty quantification in medical image segmentation with
normalizing flows
- Title(参考訳): 正規化流を伴う医用画像分割における不確かさの定量化
- Authors: Raghavendra Selvan, Frederik Faye, Jon Middleton, Akshay Pai
- Abstract要約: 条件付き正規化フロー(cFlow)に基づく新しい条件付き生成モデルを提案する。
基本的な考え方は、エンコーダの後にcFlow変換ステップを導入することにより、cVAEの表現性を高めることである。
これにより、遅延後部分布の近似が向上し、モデルがよりリッチなセグメンテーションのバリエーションを捉えることができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.9176056742068811
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Medical image segmentation is inherently an ambiguous task due to factors
such as partial volumes and variations in anatomical definitions. While in most
cases the segmentation uncertainty is around the border of structures of
interest, there can also be considerable inter-rater differences. The class of
conditional variational autoencoders (cVAE) offers a principled approach to
inferring distributions over plausible segmentations that are conditioned on
input images. Segmentation uncertainty estimated from samples of such
distributions can be more informative than using pixel level probability
scores. In this work, we propose a novel conditional generative model that is
based on conditional Normalizing Flow (cFlow). The basic idea is to increase
the expressivity of the cVAE by introducing a cFlow transformation step after
the encoder. This yields improved approximations of the latent posterior
distribution, allowing the model to capture richer segmentation variations.
With this we show that the quality and diversity of samples obtained from our
conditional generative model is enhanced. Performance of our model, which we
call cFlow Net, is evaluated on two medical imaging datasets demonstrating
substantial improvements in both qualitative and quantitative measures when
compared to a recent cVAE based model.
- Abstract(参考訳): 医用画像のセグメンテーションは本質的には、部分体積や解剖学的定義のバリエーションなどの要因により曖昧な作業である。
ほとんどの場合、セグメンテーションの不確実性は関心の構造の境界付近にあるが、レーザー間の大きな違いもある。
条件付き変分オートエンコーダ(cVAE)のクラスは、入力画像に条件付けされた可算セグメンテーション上の分布を推定する原理的なアプローチを提供する。
このような分布のサンプルから推定されるセグメンテーションの不確かさは、ピクセルレベルの確率スコアを使うよりも有益である。
本研究では,条件付き正規化フロー(cflow)に基づく新しい条件付き生成モデルを提案する。
基本的な考え方は、エンコーダの後にcFlow変換ステップを導入することにより、cVAEの表現性を高めることである。
これにより、潜在後続分布の近似が改善され、よりリッチなセグメンテーションの変動を捉えることができる。
これにより,条件生成モデルから得られた試料の品質と多様性が向上することを示す。
cflow netと呼ばれるこのモデルの性能は、最近のcvaeベースのモデルと比較して、質的および定量的な指標の両方において大幅に改善する2つの医用画像データセットで評価されている。
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