論文の概要: Automatic lesion detection, segmentation and characterization via 3D
multiscale morphological sifting in breast MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.03199v1
- Date: Tue, 7 Jul 2020 04:39:13 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-12 20:18:21.055399
- Title: Automatic lesion detection, segmentation and characterization via 3D
multiscale morphological sifting in breast MRI
- Title(参考訳): 乳房MRIにおける3次元マルチスケール形態変化による病変の自動検出・分節・特徴評価
- Authors: Hang Min, Darryl McClymont, Shekhar S. Chandra, Stuart Crozier and
Andrew P. Bradley
- Abstract要約: そこで本研究では, 乳房MRIで4次元マルチモーダル乳房MRIデータを処理し, 病変検出, セグメンテーション, キャラクタリゼーションをユーザの介入なしに統合するシステムを提案する。
提案するCADシステムは,領域候補生成,特徴抽出,領域候補分類の3段階からなる。
同じ乳房MRIデータセットで評価したシステムと比較すると,本システムは乳房病変の検出と評価において良好な性能を発揮する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.4400216692203998
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Previous studies on computer aided detection/diagnosis (CAD) in 4D breast
magnetic resonance imaging (MRI) regard lesion detection, segmentation and
characterization as separate tasks, and typically require users to manually
select 2D MRI slices or regions of interest as the input. In this work, we
present a breast MRI CAD system that can handle 4D multimodal breast MRI data,
and integrate lesion detection, segmentation and characterization with no user
intervention. The proposed CAD system consists of three major stages: region
candidate generation, feature extraction and region candidate classification.
Breast lesions are firstly extracted as region candidates using the novel 3D
multiscale morphological sifting (MMS). The 3D MMS, which uses linear
structuring elements to extract lesion-like patterns, can segment lesions from
breast images accurately and efficiently. Analytical features are then
extracted from all available 4D multimodal breast MRI sequences, including T1-,
T2-weighted and DCE sequences, to represent the signal intensity, texture,
morphological and enhancement kinetic characteristics of the region candidates.
The region candidates are lastly classified as lesion or normal tissue by the
random under-sampling boost (RUSboost), and as malignant or benign lesion by
the random forest. Evaluated on a breast MRI dataset which contains a total of
117 cases with 95 malignant and 46 benign lesions, the proposed system achieves
a true positive rate (TPR) of 0.90 at 3.19 false positives per patient (FPP)
for lesion detection and a TPR of 0.91 at a FPP of 2.95 for identifying
malignant lesions without any user intervention. The average dice similarity
index (DSI) is 0.72 for lesion segmentation. Compared with previously proposed
systems evaluated on the same breast MRI dataset, the proposed CAD system
achieves a favourable performance in breast lesion detection and
characterization.
- Abstract(参考訳): 4次元乳房MRI(MRI)におけるコンピュータ支援型診断/診断(CAD)に関する研究は、病変の検出、分節化、特徴付けを個別のタスクとして扱い、通常、ユーザーは入力として2次元MRIスライスまたは関心領域を手動で選択する必要がある。
本研究では,4次元マルチモーダル乳房MRIデータを処理し,病変検出,セグメンテーション,キャラクタリゼーションをユーザの介入なしに統合する乳房MRI CADシステムを提案する。
提案するCADシステムは,領域候補生成,特徴抽出,領域候補分類の3段階からなる。
乳腺病変は,新しい3次元マルチスケールモルフォロジー・シフティング(MMS)を用いて,まず領域候補として抽出される。
線状構造要素を用いて病変様パターンを抽出した3dmmsは,乳房画像から病変を高精度かつ効率的に区切ることができる。
その後、T1-、T2-weighted、DCE配列を含む利用可能な4D乳房MRIのすべての配列から解析的特徴を抽出し、領域候補の信号強度、テクスチャ、形態学的および拡張運動特性を表現する。
領域候補はランダムアンダーサンプリングブースト(RUSboost)により病変または正常組織と最終分類され、ランダム森林によって悪性または良性病変として分類される。
悪性腫瘍95例,良性病変46例の計117例を胸部MRIで評価し, 病変検出には1例あたり3.19偽陽性 (FPP) で0.90の正率 (TPR) , ユーザによる介入なしに悪性病変を同定するための2.95のTPR (TPR) が得られた。
平均dice類似度指数 (dsi) は、病変の分画で 0.72 である。
同じ乳房MRIデータセットで評価したシステムと比較して,本システムは乳房病変の検出と評価において良好な性能を発揮する。
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