論文の概要: Feature based Sequential Classifier with Attention Mechanism
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.11392v1
- Date: Wed, 22 Jul 2020 12:54:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-07 22:30:15.093271
- Title: Feature based Sequential Classifier with Attention Mechanism
- Title(参考訳): 注意機構を有する特徴ベースシーケンス分類器
- Authors: Sudhir Sornapudi, R. Joe Stanley, William V. Stoecker, Rodney Long,
Zhiyun Xue, Rosemary Zuna, Shelliane R. Frazier, Sameer Antani
- Abstract要約: 病理組織学的スライスを用いた骨盤内上皮内腫瘍評価は, 骨盤間変動が考慮される。
本稿では,高分解能上皮像を階層的に解析するネットワークパイプラインであるDeepCINを提案する。
実験により、DeepCINは病理学レベルのCIN分類精度を達成することが示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7123982871971924
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Cervical cancer is one of the deadliest cancers affecting women globally.
Cervical intraepithelial neoplasia (CIN) assessment using histopathological
examination of cervical biopsy slides is subject to interobserver variability.
Automated processing of digitized histopathology slides has the potential for
more accurate classification for CIN grades from normal to increasing grades of
pre-malignancy: CIN1, CIN2 and CIN3. Cervix disease is generally understood to
progress from the bottom (basement membrane) to the top of the epithelium. To
model this relationship of disease severity to spatial distribution of
abnormalities, we propose a network pipeline, DeepCIN, to analyze
high-resolution epithelium images (manually extracted from whole-slide images)
hierarchically by focusing on localized vertical regions and fusing this local
information for determining Normal/CIN classification. The pipeline contains
two classifier networks: 1) a cross-sectional, vertical segment-level sequence
generator (two-stage encoder model) is trained using weak supervision to
generate feature sequences from the vertical segments to preserve the
bottom-to-top feature relationships in the epithelium image data; 2) an
attention-based fusion network image-level classifier predicting the final CIN
grade by merging vertical segment sequences. The model produces the CIN
classification results and also determines the vertical segment contributions
to CIN grade prediction. Experiments show that DeepCIN achieves
pathologist-level CIN classification accuracy.
- Abstract(参考訳): 子宮頸癌は世界規模で女性に影響を及ぼす最も致命的な癌の1つである。
頸部生検スライドの病理組織学的検討を用いた頚椎上皮内腫瘍症(cin)の評価は,異物間変動の対象となる。
デジタル組織学スライドの自動処理は、正常なCINグレードをCIN1、CIN2、CIN3の順に分類する可能性がある。
子宮頸部疾患は一般的に底部(基膜)から上皮の上部まで進行していると理解されている。
この病気の重症度と異常の空間分布の関係をモデル化するため,ネットワークパイプラインであるDeepCINを提案し,局所垂直領域に着目して高分解能上皮画像(全スライディング画像から手動抽出)を階層的に解析し,局所情報を融合して正常/CIN分類を決定する。
パイプラインには2つの分類器ネットワークがある。
1) 横断的な垂直セグメントレベルのシーケンス生成装置(2段階エンコーダモデル)を、低監督を用いて訓練し、垂直セグメントから特徴系列を生成して、上皮画像データにおける底面と上部の特徴関係を保存する。
2)垂直セグメントシーケンスをマージして最終CINグレードを予測する注意型融合ネットワーク画像レベル分類器。
このモデルはCIN分類結果を生成し、CINグレード予測に対する垂直セグメントの寄与も決定する。
実験により、DeepCINは病理学レベルのCIN分類精度を達成することが示された。
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