論文の概要: Penalized model-based clustering of fMRI data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.06408v1
- Date: Tue, 13 Oct 2020 14:08:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-07 23:05:18.585654
- Title: Penalized model-based clustering of fMRI data
- Title(参考訳): fMRIデータのペナル化モデルに基づくクラスタリング
- Authors: Andrew DiLernia, Karina Quevedo, Jazmin Camchong, Kelvin Lim, Wei Pan,
and Lin Zhang
- Abstract要約: 機能的磁気共鳴画像(fMRI)データの利用が増加し,機能的接続性(FC)の記述に有用である。
FCは特定の神経変性疾患や精神疾患についての洞察を与えており、臨床的に重要である。
患者診断について医師に知らせるためには、FCに基づいた教師なしクラスタリングが望まれる。
本稿では,各被験者のFCネットワークを並列にクラスタリングし,各被験者のユニークなFCネットワークを推定し,共有ネットワークの特徴を推定するためのランダム共分散クラスタリングモデル(RCCM)を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.2237224955788335
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Functional magnetic resonance imaging (fMRI) data have become increasingly
available and are useful for describing functional connectivity (FC), the
relatedness of neuronal activity in regions of the brain. This FC of the brain
provides insight into certain neurodegenerative diseases and psychiatric
disorders, and thus is of clinical importance. To help inform physicians
regarding patient diagnoses, unsupervised clustering of subjects based on FC is
desired, allowing the data to inform us of groupings of patients based on
shared features of connectivity. Since heterogeneity in FC is present even
between patients within the same group, it is important to allow subject-level
differences in connectivity, while still pooling information across patients
within each group to describe group-level FC. To this end, we propose a random
covariance clustering model (RCCM) to concurrently cluster subjects based on
their FC networks, estimate the unique FC networks of each subject, and to
infer shared network features. Although current methods exist for estimating FC
or clustering subjects using fMRI data, our novel contribution is to cluster or
group subjects based on similar FC of the brain while simultaneously providing
group- and subject-level FC network estimates. The competitive performance of
RCCM relative to other methods is demonstrated through simulations in various
settings, achieving both improved clustering of subjects and estimation of FC
networks. Utility of the proposed method is demonstrated with application to a
resting-state fMRI data set collected on 43 healthy controls and 61
participants diagnosed with schizophrenia.
- Abstract(参考訳): 機能的磁気共鳴画像(fMRI)は、脳の領域における神経活動の関連性である機能的接続(FC)を記述するのに有用である。
この脳のfcは、特定の神経変性疾患や精神疾患についての洞察を提供するため、臨床的に重要である。
患者診断について医師に通知するためには、FCに基づく教師なしクラスタリングが望まれており、データの共有された接続性の特徴に基づいて、患者のグループ化を通知することができる。
FCの異種性は同一グループ内の患者の間でも存在するため、各グループ内の患者間で情報をプールしながら、グループレベルのFCを記述することが重要である。
そこで本研究では,各対象のFCネットワークを並列にクラスタリングし,各対象のユニークなFCネットワークを推定し,共有ネットワークの特徴を推定する,ランダムな共分散クラスタリングモデルを提案する。
現在,fMRIデータを用いてFCやクラスタリングの被験者を推定する手法は存在するが,本研究の新たな貢献は,グループレベルのFCネットワーク推定と主観レベルのFCネットワーク推定を同時に行うことにある。
他の手法と比較してrccmの競合性能は,様々な環境でのシミュレーションにより実証され,被験者のクラスタリングとfcネットワークの推定が向上した。
健常者43名と統合失調症61名を対象に収集した静止状態fMRIデータに適用し,本手法の有用性を実証した。
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