論文の概要: A Two-Stage Cascade Model with Variational Autoencoders and Attention Gates for MRI Brain Tumor Segmentation

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.02881v2
• Date: Sat, 28 Nov 2020 06:48:15 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2022-09-29 21:56:04.538183
• Title: A Two-Stage Cascade Model with Variational Autoencoders and Attention Gates for MRI Brain Tumor Segmentation
• Title（参考訳）: mri脳腫瘍セグメンテーションのための可変オートエンコーダとアテンションゲートを用いた2段階カスケードモデル
• Authors: Chenggang Lyu, Hai Shu
• Abstract要約: 本稿では,脳腫瘍領域分割のための2段階エンコーダデコーダモデルを提案する。 変分オートエンコーダの正規化は、オーバーフィッティング問題を防止するために両段階で利用される。 提案法は, 腫瘍全体, 腫瘍コア, 造影腫瘍全体に対して平均Diceスコア0.9041, 0.8350, 0.7958, Hausdorff距離95%の4.953, 6.299, 23.608を得る。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 2.055949720959582
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Automatic MRI brain tumor segmentation is of vital importance for the disease diagnosis, monitoring, and treatment planning. In this paper, we propose a two-stage encoder-decoder based model for brain tumor subregional segmentation. Variational autoencoder regularization is utilized in both stages to prevent the overfitting issue. The second-stage network adopts attention gates and is trained additionally using an expanded dataset formed by the first-stage outputs. On the BraTS 2020 validation dataset, the proposed method achieves the mean Dice score of 0.9041, 0.8350, and 0.7958, and Hausdorff distance (95%) of 4.953, 6.299, and 23.608 for the whole tumor, tumor core, and enhancing tumor, respectively. The corresponding results on the BraTS 2020 testing dataset are 0.8729, 0.8357, and 0.8205 for Dice score, and 11.4288, 19.9690, and 15.6711 for Hausdorff distance. The code is publicly available at https://github.com/shu-hai/two-stage-VAE-Attention-gate-BraTS2020.
• Abstract（参考訳）: 自動MRI脳腫瘍セグメンテーションは、疾患の診断、モニタリング、治療計画において極めて重要である。 本稿では,脳腫瘍領域分割のための2段階エンコーダデコーダモデルを提案する。 変分オートエンコーダの正規化は、オーバーフィッティング問題を防止するために両段階で利用される。 第2ステージネットワークはアテンションゲートを採用し、第1ステージ出力によって生成された拡張データセットを使用してトレーニングする。 brats 2020バリデーションデータセットでは,腫瘍,腫瘍コア,造影腫瘍のそれぞれについて,0.9041点,0.8350点,0.7958点,ハウスドルフ距離(95%)4.953点,6.299点,23.608点をそれぞれ達成した。 brats 2020テストデータセットの対応する結果は、diceスコアの 0.8729, 0.8357, 0.8205、ハウスドルフ距離の 11.4288, 19.9690, 15.6711 である。 コードはhttps://github.com/shu-hai/two-stage-VAE-Attention-gate-BraTS2020で公開されている。

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