論文の概要: Hotspot identification for Mapper graphs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2012.01868v1
- Date: Thu, 3 Dec 2020 12:22:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-23 14:37:38.879620
- Title: Hotspot identification for Mapper graphs
- Title(参考訳): Mapperグラフのホットスポット同定
- Authors: Ciara Frances Loughrey, Nick Orr, Anna Jurek-Loughrey, and Pawe{\l}
D{\l}otko
- Abstract要約: Mapperアルゴリズムは、ループやフレア、クラスタといった構造的に興味深い特徴をキャプチャする高次元データのグラフベースの表現を構築するために使用することができる。
精度医学などの多くの応用において、Mapper グラフは未知のコンパクトな局所化部分領域を識別するために使われてきた。
本稿では,Mapperグラフにおけるホットスポット検出のための新しいアルゴリズムを提案し,ホットスポット検出プロセスの自動化を可能にする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.330913682033217
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Mapper algorithm can be used to build graph-based representations of
high-dimensional data capturing structurally interesting features such as
loops, flares or clusters. The graph can be further annotated with additional
colouring of vertices allowing location of regions of special interest. For
instance, in many applications, such as precision medicine, Mapper graph has
been used to identify unknown compactly localized subareas within the dataset
demonstrating unique or unusual behaviours. This task, performed so far by a
researcher, can be automatized using hotspot analysis. In this work we propose
a new algorithm for detecting hotspots in Mapper graphs. It allows automatizing
of the hotspot detection process. We demonstrate the performance of the
algorithm on a number of artificial and real world datasets. We further
demonstrate how our algorithm can be used for the automatic selection of the
Mapper lens functions.
- Abstract(参考訳): Mapperアルゴリズムは、ループ、フレア、クラスタなどの構造的に興味深い特徴をキャプチャする高次元データのグラフベースの表現を構築するために使用できる。
グラフはさらに、特別な興味のある領域の位置を指定できるように、頂点のさらなる色付けで注釈を付けることができる。
例えば、精密医療などの多くのアプリケーションにおいて、Mapperグラフはデータセット内の未知のコンパクトな局所化部分領域を識別するために使われてきた。
このタスクは研究者がこれまで行ってきたもので、ホットスポット分析を使って自動化することができる。
本研究では,マッパーグラフ中のホットスポットを検出する新しいアルゴリズムを提案する。
ホットスポット検出プロセスの自動化を可能にする。
本稿では,人工および実世界のデータセット上でのアルゴリズムの性能を示す。
さらに、我々のアルゴリズムがMapperレンズ関数の自動選択にどのように使えるかを示す。
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