論文の概要: Bayesian Graph Neural Networks for Molecular Property Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2012.02089v1
- Date: Wed, 25 Nov 2020 22:32:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-21 03:58:12.689589
- Title: Bayesian Graph Neural Networks for Molecular Property Prediction
- Title(参考訳): 分子特性予測のためのベイズグラフニューラルネットワーク
- Authors: George Lamb, Brooks Paige
- Abstract要約: 本研究では、QM9回帰データセットを用いて、有向MPNNに適用されたベイズ的手法のセットをベンチマークする。
読み出しパラメータとメッセージパッシングパラメータの両方で不確実性を捕捉すると、下流分子探索タスクにおける予測精度、キャリブレーション、性能が向上することがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.160090982544867
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Graph neural networks for molecular property prediction are frequently
underspecified by data and fail to generalise to new scaffolds at test time. A
potential solution is Bayesian learning, which can capture our uncertainty in
the model parameters. This study benchmarks a set of Bayesian methods applied
to a directed MPNN, using the QM9 regression dataset. We find that capturing
uncertainty in both readout and message passing parameters yields enhanced
predictive accuracy, calibration, and performance on a downstream molecular
search task.
- Abstract(参考訳): 分子特性予測のためのグラフニューラルネットワークは、しばしばデータによって過小評価され、テスト時に新しい足場に一般化できない。
潜在的な解決策はベイズ学習であり、モデルパラメータの不確かさを捉えることができる。
本研究は、qm9回帰データセットを用いて、有向mpnnに適用するベイズ法をベンチマークする。
読み出しパラメータとメッセージパッシングパラメータの両方で不確実性を捕捉すると、下流分子探索タスクにおける予測精度、キャリブレーション、性能が向上することがわかった。
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