論文の概要: DINs: Deep Interactive Networks for Neurofibroma Segmentation in
Neurofibromatosis Type 1 on Whole-Body MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.03388v1
- Date: Mon, 7 Jun 2021 07:29:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-08 18:02:27.185783
- Title: DINs: Deep Interactive Networks for Neurofibroma Segmentation in
Neurofibromatosis Type 1 on Whole-Body MRI
- Title（参考訳）: dins : 全身mriを用いた神経線維腫1型の神経線維腫分割のための深層ネットワーク
- Authors: Jian-Wei Zhang, Wei Chen, K. Ina Ly, Xubin Zhang, Fan Yan, Justin
Jordan, Gordon Harris, Scott Plotkin, Pengyi Hao, and Wenli Cai
- Abstract要約: 自動畳み込みニューラルネットワーク(CNN)の限界に対処するディープ・インタラクティブ・ネットワーク(DIN)を提案する。
本稿では,ユーザインタラクションを空間的・外見的なガイドマップに変換する簡易かつ効果的なExpDT(Exponential Distance Transform)を提案する。
実験の結果,DSCの44%と14%の大幅な改善が得られた。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 7.760497213052019
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Neurofibromatosis type 1 (NF1) is an autosomal dominant tumor predisposition
syndrome that involves the central and peripheral nervous systems. Accurate
detection and segmentation of neurofibromas are essential for assessing tumor
burden and longitudinal tumor size changes. Automatic convolutional neural
networks (CNNs) are sensitive and vulnerable as tumors' variable anatomical
location and heterogeneous appearance on MRI. In this study, we propose deep
interactive networks (DINs) to address the above limitations. User interactions
guide the model to recognize complicated tumors and quickly adapt to
heterogeneous tumors. We introduce a simple but effective Exponential Distance
Transform (ExpDT) that converts user interactions into guide maps regarded as
the spatial and appearance prior. Comparing with popular Euclidean and geodesic
distances, ExpDT is more robust to various image sizes, which reserves the
distribution of interactive inputs. Furthermore, to enhance the tumor-related
features, we design a deep interactive module to propagate the guides into
deeper layers. We train and evaluate DINs on three MRI data sets from NF1
patients. The experiment results yield significant improvements of 44% and 14%
in DSC comparing with automated and other interactive methods, respectively. We
also experimentally demonstrate the efficiency of DINs in reducing user burden
when comparing with conventional interactive methods. The source code of our
method is available at \url{https://github.com/Jarvis73/DINs}.
- Abstract（参考訳）: 神経線維腫症1型(英: Neurofibromatosis type 1, NF1)は、中枢神経系と末梢神経系を含む常染色体優性腫瘍の前置症候群である。
神経線維腫の正確な検出とセグメンテーションは,腫瘍の負担と縦断的な腫瘍の大きさの変化を評価する上で重要である。
自動畳み込みニューラルネットワーク(cnns)は腫瘍の可変解剖学的位置やmri上の異種な外観として敏感で脆弱である。
本研究では,上記の制約に対処するために,深層インタラクティブネットワーク(dins)を提案する。
ユーザインタラクションは、複雑な腫瘍を認識し、異種腫瘍に迅速に適応するようにモデルを導く。
本稿では,ユーザインタラクションを空間的・外見的なガイドマップに変換する簡易かつ効果的なExpDT(Exponential Distance Transform)を提案する。
一般的なユークリッド距離や測地距離と比較して、ExpDTは様々な画像サイズに対してより堅牢であり、インタラクティブな入力の分布を保っている。
さらに,腫瘍関連機能を強化するため,ガイドをより深い層に伝播する深いインタラクティブモジュールを設計した。
NF1患者の3つのMRIデータセットからDINを訓練し,評価した。
実験の結果,dscでは44%,dscでは14%の大幅な改善が得られた。
また,従来の対話型手法と比較して,ユーザの負担を軽減するためのDINの効率を実験的に実証した。
我々のメソッドのソースコードは \url{https://github.com/Jarvis73/DINs} で入手できる。
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