論文の概要: Semi-supervised Cell Detection in Time-lapse Images Using Temporal
Consistency
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.08639v1
- Date: Mon, 19 Jul 2021 06:40:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-20 14:57:36.693664
- Title: Semi-supervised Cell Detection in Time-lapse Images Using Temporal
Consistency
- Title(参考訳): 時間一貫性を用いた時間経過画像における半教師付き細胞検出
- Authors: Kazuya Nishimura and Hyeonwoo Cho and Ryoma Bise
- Abstract要約: 本研究では,ラベル付き画像とラベル付き画像との時間経過シーケンスを効果的に利用する半教師付き細胞検出法を提案する。
まず,一方のラベル付き画像を用いたセル検出ネットワークを訓練し,未ラベル付き画像と訓練されたネットワークを推定する。
次に,検出した細胞をラベル付きフレームから遠方まで追跡することにより,推定値から高信頼位置を選択する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.20554144865699
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Cell detection is the task of detecting the approximate positions of cell
centroids from microscopy images. Recently, convolutional neural network-based
approaches have achieved promising performance. However, these methods require
a certain amount of annotation for each imaging condition. This annotation is a
time-consuming and labor-intensive task. To overcome this problem, we propose a
semi-supervised cell-detection method that effectively uses a time-lapse
sequence with one labeled image and the other images unlabeled. First, we train
a cell-detection network with a one-labeled image and estimate the unlabeled
images with the trained network. We then select high-confidence positions from
the estimations by tracking the detected cells from the labeled frame to those
far from it. Next, we generate pseudo-labels from the tracking results and
train the network by using pseudo-labels. We evaluated our method for seven
conditions of public datasets, and we achieved the best results relative to
other semi-supervised methods. Our code is available at
https://github.com/naivete5656/SCDTC
- Abstract(参考訳): 細胞検出は、顕微鏡画像から細胞中心体の近似位置を検出するタスクである。
近年,畳み込みニューラルネットワークに基づくアプローチが有望な性能を達成している。
しかし,これらの手法では,各撮影条件に対して一定量のアノテーションが必要となる。
このアノテーションは時間がかかり、労力がかかるタスクです。
そこで本研究では,ラベル付き画像とラベル付き画像との時間差シーケンスを効果的に利用する半教師付きセル検出手法を提案する。
まず,一方のラベル付き画像を用いたセル検出ネットワークを訓練し,未ラベル付き画像と訓練されたネットワークを推定する。
次に, 検出された細胞をラベル付きフレームから遠方へ追跡することで, 高信頼位置を推定から選択する。
次に、追跡結果から擬似ラベルを生成し、擬似ラベルを用いてネットワークを訓練する。
提案手法を公開データセットの7つの条件で評価し,他の半教師付き手法と比較して最良の結果を得た。
私たちのコードはhttps://github.com/naivete5656/SCDTCで利用可能です。
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