論文の概要: Evaluating Transformer based Semantic Segmentation Networks for
Pathological Image Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2108.11993v1
- Date: Thu, 26 Aug 2021 18:46:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-08-30 23:32:09.581904
- Title: Evaluating Transformer based Semantic Segmentation Networks for
Pathological Image Segmentation
- Title(参考訳): 病理画像分割のためのトランスフォーマティックセグメンテーションネットワークの評価
- Authors: Cam Nguyen, Zuhayr Asad, Yuankai Huo
- Abstract要約: 病理は癌診断において重要な役割を担っている。
コンピュータ支援型病理画像解析において, 様々なCNNを用いた病理画像分割手法が開発されている。
Transformer Neural Network(Transformer)は、新たなディープラーニングパラダイムとして、画像全体にわたるグローバルな長距離依存関係をキャプチャする、ユニークなメリットを示している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.7029872968576947
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Histopathology has played an essential role in cancer diagnosis. With the
rapid advances in convolutional neural networks (CNN). Various CNN-based
automated pathological image segmentation approaches have been developed in
computer-assisted pathological image analysis. In the past few years,
Transformer neural networks (Transformer) have shown the unique merit of
capturing the global long distance dependencies across the entire image as a
new deep learning paradigm. Such merit is appealing for exploring spatially
heterogeneous pathological images. However, there have been very few, if any,
studies that have systematically evaluated the current Transformer based
approaches in pathological image segmentation. To assess the performance of
Transformer segmentation models on whole slide images (WSI), we quantitatively
evaluated six prevalent transformer-based models on tumor segmentation, using
the widely used PAIP liver histopathological dataset. For a more comprehensive
analysis, we also compare the transformer-based models with six major
traditional CNN-based models. The results show that the Transformer-based
models exhibit a general superior performance over the CNN-based models. In
particular, Segmenter, Swin-Transformer and TransUNet, all transformer-based,
came out as the best performers among the twelve evaluated models.
- Abstract(参考訳): 病理は癌診断において重要な役割を担っている。
畳み込みニューラルネットワーク(CNN)の急速な進歩とともに。
コンピュータ支援型病理画像解析において, 様々なCNNを用いた病理画像分割手法が開発されている。
ここ数年、Transformer Neural Network(Transformer)は、新しいディープラーニングパラダイムとして、画像全体にわたるグローバルな長距離依存関係をキャプチャするユニークなメリットを示してきた。
このような利点は、空間的に異質な病理像の探索に有益である。
しかし,病的イメージセグメンテーションにおける現在のトランスフォーマーに基づくアプローチを体系的に評価した研究はほとんどない。
スライド画像全体(WSI)におけるトランスフォーマーセグメンテーションモデルの性能を評価するため,腫瘍セグメンテーションに関する6つの有意なトランスフォーマーモデルについて,PAIP肝病理組織学的データセットを用いて定量的に評価した。
より包括的な分析のために、トランスフォーマーベースのモデルを6つの主要なcnnベースのモデルと比較する。
その結果,トランスフォーマーモデルの方がcnnモデルよりも優れた性能を示すことがわかった。
特に、Segmenter、Swin-Transformer、TransUNetはトランスフォーマーベースで、評価された12モデルの中で最高のパフォーマーとして登場した。
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