論文の概要: Explainable Artificial Intelligence for Pharmacovigilance: What Features
Are Important When Predicting Adverse Outcomes?
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2112.13210v1
- Date: Sat, 25 Dec 2021 09:00:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-12-28 15:12:34.165079
- Title: Explainable Artificial Intelligence for Pharmacovigilance: What Features
Are Important When Predicting Adverse Outcomes?
- Title(参考訳): 薬理ビジランスのための説明可能な人工知能:副次的なアウトカムを予測する上で重要な特徴は何か?
- Authors: Isaac Ronald Ward, Ling Wang, Juan lu, Mohammed Bennamoun, Girish
Dwivedi, Frank M Sanfilippo
- Abstract要約: 我々は、個人の健康情報を入力として取り込むモデルを作成し、その個人が急性冠症候群を発症する確率を予測する。
XAIを用いて、特定の薬物がこれらのACS予測に与える影響を定量化した。
ロフェコキシブとセロコキシブの薬物放出特性は、ACS関連副作用予測に0以上の寄与があることが判明した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 21.346072731259248
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Explainable Artificial Intelligence (XAI) has been identified as a viable
method for determining the importance of features when making predictions using
Machine Learning (ML) models. In this study, we created models that take an
individual's health information (e.g. their drug history and comorbidities) as
inputs, and predict the probability that the individual will have an Acute
Coronary Syndrome (ACS) adverse outcome. Using XAI, we quantified the
contribution that specific drugs had on these ACS predictions, thus creating an
XAI-based technique for pharmacovigilance monitoring, using ACS as an example
of the adverse outcome to detect. Individuals aged over 65 who were supplied
Musculo-skeletal system (anatomical therapeutic chemical (ATC) class M) or
Cardiovascular system (ATC class C) drugs between 1993 and 2009 were
identified, and their drug histories, comorbidities, and other key features
were extracted from linked Western Australian datasets. Multiple ML models were
trained to predict if these individuals would have an ACS related adverse
outcome (i.e., death or hospitalisation with a discharge diagnosis of ACS), and
a variety of ML and XAI techniques were used to calculate which features --
specifically which drugs -- led to these predictions. The drug dispensing
features for rofecoxib and celecoxib were found to have a greater than zero
contribution to ACS related adverse outcome predictions (on average), and it
was found that ACS related adverse outcomes can be predicted with 72% accuracy.
Furthermore, the XAI libraries LIME and SHAP were found to successfully
identify both important and unimportant features, with SHAP slightly
outperforming LIME. ML models trained on linked administrative health datasets
in tandem with XAI algorithms can successfully quantify feature importance, and
with further development, could potentially be used as pharmacovigilance
monitoring techniques.
- Abstract(参考訳): 説明可能な人工知能(xai)は、機械学習(ml)モデルを用いた予測を行う際に特徴の重要性を決定するための有効な方法として認識されている。
本研究では、個人の健康情報(例えば、その薬物の歴史や共生性)を入力として取り込んだモデルを作成し、急性冠症候群(ACS)の予後を予測した。
XAIを用いて、特定の薬物がこれらのACS予測に与えた貢献を定量化し、ACSが検出する有害な結果の例として、薬物移動監視のためのXAIベースのテクニックを作成した。
1993年から2009年の間、65歳以上の患者がM群(解剖学的治療薬M群)または心血管系(ATCクラスC群)の薬物を投与し、その薬歴、共同性、その他の重要な特徴をオーストラリア西部のデータセットから抽出した。
複数のMLモデルは、これらの個人がACSに関連する副作用(すなわち、ALSの退院診断を伴う死亡または入院)を予測するために訓練され、MLとXAIの様々な手法が、これらの予測にどの特徴(具体的にどの薬物が原因であるか)を計算するために使用された。
その結果、ロフェコキシブとセロコキシブの薬物放出特性は、ACS関連副作用予測(平均)に0以上の寄与があることが判明し、ACS関連副作用予測は72%の精度で予測できることが判明した。
さらに,XAI ライブラリ LIME と SHAP は重要な特徴と重要でない特徴の両方を同定し,SHAP は LIME をわずかに上回った。
XAIアルゴリズムと連動した管理健康データセットに基づいてトレーニングされたMLモデルは、機能の重要性の定量化に成功し、さらなる発展に伴い、薬物移動監視技術として使われる可能性がある。
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