論文の概要: Extending compositional data analysis from a graph signal processing
perspective
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2201.10610v1
- Date: Tue, 25 Jan 2022 20:14:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-01-27 13:25:30.513467
- Title: Extending compositional data analysis from a graph signal processing
perspective
- Title(参考訳): グラフ信号処理の観点からの合成データ解析の拡張
- Authors: Christopher Rieser and Peter Filzmoser
- Abstract要約: 本稿では,合成データ解析とグラフ信号処理を関連付ける。
これはアッチソン幾何学を、選択された対数比のみを考慮できる設定に拡張する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.066048003460524
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Traditional methods for the analysis of compositional data consider the
log-ratios between all different pairs of variables with equal weight,
typically in the form of aggregated contributions. This is not meaningful in
contexts where it is known that a relationship only exists between very
specific variables (e.g.~for metabolomic pathways), while for other pairs a
relationship does not exist. Modeling absence or presence of relationships is
done in graph theory, where the vertices represent the variables, and the
connections refer to relations. This paper links compositional data analysis
with graph signal processing, and it extends the Aitchison geometry to a
setting where only selected log-ratios can be considered. The presented
framework retains the desirable properties of scale invariance and
compositional coherence. An additional extension to include absolute
information is readily made. Examples from bioinformatics and geochemistry
underline the usefulness of thisapproach in comparison to standard methods for
compositional data analysis.
- Abstract(参考訳): 構成データの伝統的な分析方法は、同じ重さの変数の全ての異なる対間の対比(英語版)(log-ratios)を考える。
これは、特定の変数(例えばメタボロミック経路)の間にのみ関係が存在することが分かっている文脈では意味を持たないが、他のペアでは関係は存在しない。
関係の欠如や存在のモデル化はグラフ理論において行われ、頂点は変数を表し、接続は関係を表す。
本稿では,合成データ解析とグラフ信号処理を関連付け,Aitchison幾何を,選択した対数比のみを考慮可能な設定に拡張する。
提案するフレームワークはスケール不変性と構成コヒーレンスの望ましい特性を保っている。
絶対情報を含む追加拡張を容易に行う。
バイオインフォマティクスや地球化学の例は、合成データ分析の標準的な方法と比較して、このアプローチの有用性を示唆している。
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