論文の概要: BEFANA: A Tool for Biodiversity-Ecosystem Functioning Assessment by
Network Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.11687v1
- Date: Mon, 21 Mar 2022 16:51:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-23 15:13:32.802159
- Title: BEFANA: A Tool for Biodiversity-Ecosystem Functioning Assessment by
Network Analysis
- Title(参考訳): BEFANA:ネットワーク分析による生物多様性・生態系機能評価ツール
- Authors: Martin Marzidov\v{s}ek, Vid Podpe\v{c}an, Erminia Conti, Marko
Debeljak, Christian Mulder
- Abstract要約: BEFANAは、生態学的ネットワーク分析と可視化のためのフリーでオープンソースのソフトウェアツールである。
生態学者のニーズに適応し、生態ネットワークのトポロジとダイナミクスを研究することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: BEFANA is a free and open-source software tool for ecological network
analysis and visualisation. It is adapted to ecologists' needs and allows them
to study the topology and dynamics of ecological networks as well as apply
selected machine learning algorithms. BEFANA is implemented in Python, and
structured as an ordered collection of interactive computational notebooks. It
relies on widely used open-source libraries, and aims to achieve simplicity,
interactivity, and extensibility. BEFANA provides methods and implementations
for data loading and preprocessing, network analysis and interactive
visualisation, modelling with experimental data, and predictive modelling with
machine learning. We showcase BEFANA through a concrete example of a detrital
soil food web of agricultural grasslands, and demonstrate all of its main
components and functionalities.
- Abstract(参考訳): BEFANAは、生態学的ネットワーク分析と可視化のためのフリーでオープンソースのソフトウェアツールである。
生態学者のニーズに適合し、生態ネットワークのトポロジーとダイナミクスを研究し、選択した機械学習アルゴリズムを適用することができる。
BEFANAはPythonで実装されており、対話型計算ノートブックの順序づけられたコレクションとして構成されている。
広く使われているオープンソースライブラリに依存しており、シンプルさ、対話性、拡張性の実現を目指している。
BEFANAは、データローディングと前処理、ネットワーク分析とインタラクティブな可視化、実験データによるモデリング、機械学習による予測モデリングのためのメソッドと実装を提供する。
農業用草地の土壌食物網の具体的な例を通してBEFANAを紹介し,その主な構成要素と機能について紹介する。
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