論文の概要: BrainIB: Interpretable Brain Network-based Psychiatric Diagnosis with
Graph Information Bottleneck
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2205.03612v2
- Date: Tue, 30 May 2023 02:58:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-01 03:05:07.583856
- Title: BrainIB: Interpretable Brain Network-based Psychiatric Diagnosis with
Graph Information Bottleneck
- Title(参考訳): BrainIB:グラフ情報付き脳ネットワークを用いた精神科診断
- Authors: Kaizhong Zheng, Shujian Yu, Baojuan Li, Robert Jenssen, and Badong
Chen
- Abstract要約: 機能的磁気共鳴画像(fMRI)解析のための新しいグラフニューラルネットワーク(GNN)フレームワークBrainIBを提案する。
BrainIBは、脳内の最も情報に富むエッジ(つまり、部分グラフ)を識別し、目に見えないデータにうまく一般化することができる。
我々は2つのマルチサイト大規模データセット上での8つの一般的な脳ネットワーク分類手法に対するBrainIBの性能評価を行った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 35.754092850773944
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Developing a new diagnostic models based on the underlying biological
mechanisms rather than subjective symptoms for psychiatric disorders is an
emerging consensus. Recently, machine learning-based classifiers using
functional connectivity (FC) for psychiatric disorders and healthy controls are
developed to identify brain markers. However, existing machine learningbased
diagnostic models are prone to over-fitting (due to insufficient training
samples) and perform poorly in new test environment. Furthermore, it is
difficult to obtain explainable and reliable brain biomarkers elucidating the
underlying diagnostic decisions. These issues hinder their possible clinical
applications. In this work, we propose BrainIB, a new graph neural network
(GNN) framework to analyze functional magnetic resonance images (fMRI), by
leveraging the famed Information Bottleneck (IB) principle. BrainIB is able to
identify the most informative edges in the brain (i.e., subgraph) and
generalizes well to unseen data. We evaluate the performance of BrainIB against
8 popular brain network classification methods on two multi-site, largescale
datasets and observe that our BrainIB always achieves the highest diagnosis
accuracy. It also discovers the subgraph biomarkers which are consistent to
clinical and neuroimaging findings.
- Abstract(参考訳): 精神疾患の主観的症状ではなく、基礎となる生物学的メカニズムに基づく新しい診断モデルの開発は、新たなコンセンサスである。
近年,脳マーカーを識別するために,機能的接続(fc)を用いた精神疾患と健康管理のための機械学習に基づく分類器が開発されている。
しかし、既存の機械学習ベースの診断モデルは(トレーニングサンプルが不十分なため)過度に適合する傾向があり、新しいテスト環境では不十分である。
さらに、基礎となる診断決定を解明する説明可能で信頼性の高い脳バイオマーカーを得ることが困難である。
これらの問題は臨床応用を妨げている。
本研究では,高名なInformation Bottleneck(IB)の原理を利用して,機能的磁気共鳴画像(fMRI)を解析するための新しいグラフニューラルネットワーク(GNN)フレームワークであるBrainIBを提案する。
BrainIBは、脳内の最も情報に富むエッジ(つまり、部分グラフ)を識別し、見えないデータにうまく一般化することができる。
我々は,2つのマルチサイト大規模データセットにおいて,BrainIBを8つの一般的な脳ネットワーク分類法と比較し,BrainIBが常に最も高い診断精度を達成することを観察した。
また、臨床および神経画像所見と一致したサブグラフバイオマーカーも発見する。
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