論文の概要: SEMPAI: a Self-Enhancing Multi-Photon Artificial Intelligence for
prior-informed assessment of muscle function and pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2210.16273v1
- Date: Fri, 28 Oct 2022 17:03:04 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-31 15:58:35.985885
- Title: SEMPAI: a Self-Enhancing Multi-Photon Artificial Intelligence for
prior-informed assessment of muscle function and pathology
- Title(参考訳): SEMPAI:筋機能と病理の事前評価のための多光子人工知能
- Authors: Alexander M\"uhlberg, Paul Ritter, Simon Langer, Chlo\"e Goossens,
Stefanie N\"ubler, Dominik Schneidereit, Oliver Taubmann, Felix Denzinger,
Dominik N\"orenberg, Michael Haug, Wolfgang H. Goldmann, Andreas K. Maier,
Oliver Friedrich, Lucas Kreiss
- Abstract要約: 本稿では,仮説駆動型先行処理をデータ駆動型ディープラーニングアプローチに統合した,SEMPAI(Self-Enhancing Multi-Photon Artificial Intelligence)を紹介する。
SEMPAIは、小さなデータセットの予測を可能にするために、いくつかのタスクを共同で学習する。
SEMPAIは、少ないデータを含む7つの予測タスクのうち6つにおいて、最先端のバイオマーカーよりも優れています。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 48.54269377408277
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep learning (DL) shows notable success in biomedical studies. However, most
DL algorithms work as a black box, exclude biomedical experts, and need
extensive data. We introduce the Self-Enhancing Multi-Photon Artificial
Intelligence (SEMPAI), that integrates hypothesis-driven priors in a
data-driven DL approach for research on multiphoton microscopy (MPM) of muscle
fibers. SEMPAI utilizes meta-learning to optimize prior integration, data
representation, and neural network architecture simultaneously. This allows
hypothesis testing and provides interpretable feedback about the origin of
biological information in MPM images. SEMPAI performs joint learning of several
tasks to enable prediction for small datasets. The method is applied on an
extensive multi-study dataset resulting in the largest joint analysis of
pathologies and function for single muscle fibers. SEMPAI outperforms
state-of-the-art biomarkers in six of seven predictive tasks, including those
with scarce data. SEMPAI's DL models with integrated priors are superior to
those without priors and to prior-only machine learning approaches.
- Abstract(参考訳): 深層学習(DL)は医学研究において顕著な成功を収めた。
しかし、ほとんどのDLアルゴリズムはブラックボックスとして機能し、生物医学の専門家を除外し、広範なデータを必要とする。
筋線維の多光子顕微鏡(MPM)研究のためのデータ駆動型DLアプローチにおいて仮説駆動型先行情報を統合したSEMPAI(Self-Enhancing Multi-Photon Artificial Intelligence)を導入する。
SEMPAIは、メタ学習を使用して、事前統合、データ表現、ニューラルネットワークアーキテクチャを同時に最適化する。
これは仮説テストを可能にし、MPM画像における生物学的情報の起源に関する解釈可能なフィードバックを提供する。
SEMPAIは、小さなデータセットの予測を可能にするために、いくつかのタスクを共同で学習する。
本手法は, 単一筋線維の病態と機能に関する最大ジョイント解析を行う, 広範囲のマルチスタディデータセットに適用できる。
SEMPAIは、7つの予測タスクのうち6つで最先端のバイオマーカーを上回っている。
SEMPAIのDLモデルは、事前のないものや、事前のみの機械学習アプローチよりも優れている。
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