論文の概要: CI-GNN: A Granger Causality-Inspired Graph Neural Network for
Interpretable Brain Network-Based Psychiatric Diagnosis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2301.01642v3
- Date: Sun, 28 Jan 2024 08:56:23 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-31 00:53:42.712713
- Title: CI-GNN: A Granger Causality-Inspired Graph Neural Network for
Interpretable Brain Network-Based Psychiatric Diagnosis
- Title(参考訳): CI-GNN:脳ネットワークに基づく精神診断のためのグランガー因果グラフニューラルネットワーク
- Authors: Kaizhong Zheng, Shujian Yu, Badong Chen
- Abstract要約: 本稿では,脳ネットワークに基づく精神医学的診断を説明するためのグラフニューラルネットワーク(CI-GNN)を提案する。
CI-GNNは、それぞれ元のグラフの因果的側面と非因果的側面を符号化する、アンタングル化サブグラフレベル表現のアルファとベータを学習する。
3つのベースラインGNNと4つの最先端GNNの合成データと3つの大規模脳疾患データセットに対するCI-GNNの性能を実証的に評価した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 40.26902764049346
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: There is a recent trend to leverage the power of graph neural networks (GNNs)
for brain-network based psychiatric diagnosis, which,in turn, also motivates an
urgent need for psychiatrists to fully understand the decision behavior of the
used GNNs. However, most of the existing GNN explainers are either post-hoc in
which another interpretive model needs to be created to explain a well-trained
GNN, or do not consider the causal relationship between the extracted
explanation and the decision, such that the explanation itself contains
spurious correlations and suffers from weak faithfulness. In this work, we
propose a granger causality-inspired graph neural network (CI-GNN), a built-in
interpretable model that is able to identify the most influential subgraph
(i.e., functional connectivity within brain regions) that is causally related
to the decision (e.g., major depressive disorder patients or healthy controls),
without the training of an auxillary interpretive network. CI-GNN learns
disentangled subgraph-level representations {\alpha} and \b{eta} that encode,
respectively, the causal and noncausal aspects of original graph under a graph
variational autoencoder framework, regularized by a conditional mutual
information (CMI) constraint. We theoretically justify the validity of the CMI
regulation in capturing the causal relationship. We also empirically evaluate
the performance of CI-GNN against three baseline GNNs and four state-of-the-art
GNN explainers on synthetic data and three large-scale brain disease datasets.
We observe that CI-GNN achieves the best performance in a wide range of metrics
and provides more reliable and concise explanations which have clinical
evidence.The source code and implementation details of CI-GNN are freely
available at GitHub repository (https://github.com/ZKZ-Brain/CI-GNN/).
- Abstract(参考訳): 近年、脳ネットワークに基づく精神医学診断にグラフニューラルネットワーク(GNN)のパワーを活用する傾向があり、これはまた、使用済みのGNNの決定行動を完全に理解するために精神科医が緊急に必要であることを意味している。
しかしながら、既存のgnn説明者は、十分に訓練されたgnnを説明するために別の解釈モデルを作成する必要があるポストホックであるか、抽出された説明と決定との因果関係を考慮していないため、説明自体がスプリアス相関を含み、弱い忠実さに苦しむ。
本研究では,その決定に因果関係のある最も影響力のある部分グラフ(例えば,大うつ病患者や健常なコントロールなど)を,補助的解釈ネットワークの訓練なしで識別可能な,組み込みの解釈モデルであるgranger causality-inspired graph neural network(ci-gnn)を提案する。
CI-GNNは、それぞれ、条件付き相互情報(CMI)制約によって正規化されたグラフ変動オートエンコーダフレームワークの下で、元のグラフの因果的側面と非因果的側面をエンコードする非絡み合った部分グラフレベルの表現 {\alpha} と \b{eta} を学習する。
因果関係の把握におけるCMI規制の有効性を理論的に正当化する。
また,3つのベースラインGNNと4つの最先端GNNの合成データと3つの大規模脳疾患データセットに対するCI-GNNの性能を実証的に評価した。
CI-GNNのソースコードと実装の詳細はGitHubリポジトリで無償公開されている(https://github.com/ZKZ-Brain/CI-GNN/)。
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