論文の概要: Segmentation method for cerebral blood vessels from MRA using hysteresis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.05113v1
- Date: Thu, 9 Mar 2023 08:34:21 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-10 15:36:01.420436
- Title: Segmentation method for cerebral blood vessels from MRA using hysteresis
- Title(参考訳): ヒステリシスを用いたMRA脳血管の分画法
- Authors: Georgia Kenyon, Stephan Lau, Michael A. Chappell and Mark Jenkinson
- Abstract要約: 我々は,磁気共鳴血管造影法により,血管の真実を生成する古典的セグメンテーション法を開発した。
この方法は、サイズ固有のヘッセンフィルタ、DL閾値、接続されたコンポーネント補正を組み合わせたものである。
GitHubで入手可能なこのメソッドは、コンテナセグメンテーションのためのDLモデルをトレーニングするために使用することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.6516902135723863
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Segmentation of cerebral blood vessels from Magnetic Resonance Imaging (MRI)
is an open problem that could be solved with deep learning (DL). However,
annotated data for training is often scarce. Due to the absence of open-source
tools, we aim to develop a classical segmentation method that generates vessel
ground truth from Magnetic Resonance Angiography for DL training of
segmentation across a variety of modalities. The method combines size-specific
Hessian filters, hysteresis thresholding and connected component correction.
The optimal choice of processing steps was evaluated with a blinded scoring by
a clinician using 24 3D images. The results show that all method steps are
necessary to produce the highest (14.2/15) vessel segmentation quality score.
Omitting the connected component correction caused the largest quality loss.
The method, which is available on GitHub, can be used to train DL models for
vessel segmentation.
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴イメージング(MRI)による脳血管の分画は、ディープラーニング(DL)で解決できるオープンな問題である。
しかし、トレーニング用の注釈付きデータは少ないことが多い。
オープンソースツールが欠如しているため,磁気共鳴血管造影法から血管の真実を生成する古典的なセグメンテーション手法を開発し,様々なモダリティにまたがるセグメンテーションのDLトレーニングを目指す。
この方法は、サイズ固有のヘッセンフィルタ、ヒステリシスしきい値および連結成分補正を組み合わせたものである。
プロセッシングステップの最適選択は,24次元画像を用いた臨床医によるブラインドスコアを用いて評価した。
その結果、最も高い(14.2/15)容器セグメンテーション品質スコアを得るためには、すべての方法ステップが必要であることがわかった。
コネクテッドコンポーネントの修正を省略することで、品質の損失が最大になった。
GitHubで入手可能なこのメソッドは、コンテナセグメンテーションのためのDLモデルをトレーニングするために使用することができる。
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