論文の概要: Frozen Language Model Helps ECG Zero-Shot Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.12311v1
- Date: Wed, 22 Mar 2023 05:01:14 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-23 15:21:08.875337
- Title: Frozen Language Model Helps ECG Zero-Shot Learning
- Title(参考訳): ecgゼロショット学習を支援する凍結言語モデル
- Authors: Jun Li, Che Liu, Sibo Cheng, Rossella Arcucci, Shenda Hong
- Abstract要約: マルチモーダルECG-Text Self-supervised pre-training (METS)を提案する。
トレーニング可能なECGエンコーダと凍結言語モデルを用いて,ペアのECGを組込み,個別に自動で臨床報告を行う。
下流の分類タスクでは、METSは注釈付きデータを使わずに、約10%のパフォーマンス改善を実現している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.974685769614062
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The electrocardiogram (ECG) is one of the most commonly used non-invasive,
convenient medical monitoring tools that assist in the clinical diagnosis of
heart diseases. Recently, deep learning (DL) techniques, particularly
self-supervised learning (SSL), have demonstrated great potential in the
classification of ECG. SSL pre-training has achieved competitive performance
with only a small amount of annotated data after fine-tuning. However, current
SSL methods rely on the availability of annotated data and are unable to
predict labels not existing in fine-tuning datasets. To address this challenge,
we propose Multimodal ECG-Text Self-supervised pre-training (METS), the first
work to utilize the auto-generated clinical reports to guide ECG SSL
pre-training. We use a trainable ECG encoder and a frozen language model to
embed paired ECG and automatically machine-generated clinical reports
separately. The SSL aims to maximize the similarity between paired ECG and
auto-generated report while minimize the similarity between ECG and other
reports. In downstream classification tasks, METS achieves around 10%
improvement in performance without using any annotated data via zero-shot
classification, compared to other supervised and SSL baselines that rely on
annotated data. Furthermore, METS achieves the highest recall and F1 scores on
the MIT-BIH dataset, despite MIT-BIH containing different classes of ECG
compared to the pre-trained dataset. The extensive experiments have
demonstrated the advantages of using ECG-Text multimodal self-supervised
learning in terms of generalizability, effectiveness, and efficiency.
- Abstract(参考訳): 心電図 (ECG) は、心臓疾患の臨床的診断を支援する非侵襲的で便利な医療モニタリングツールの1つである。
近年、深層学習(DL)技術、特に自己教師付き学習(SSL)は、心電図の分類において大きな可能性を示している。
SSL事前トレーニングは、微調整後に少量の注釈付きデータで競合性能を達成した。
しかし、現在のSSLメソッドはアノテーション付きデータの可用性に依存しており、微調整データセットに存在しないラベルを予測できない。
この課題に対処するため、我々は、自動生成臨床報告を利用してECG SSL事前トレーニングをガイドするMultimodal ECG-Text Self-supervised Pre-training (METS)を提案する。
トレーニング可能なECGエンコーダと凍結言語モデルを用いて,ペアのECGを組込み,自動で臨床報告を行う。
SSLの目的は、ペア化されたECGと自動生成されたレポートの類似性を最大化し、ECGと他のレポートの類似性を最小化することである。
下流の分類タスクにおいて、METSは、アノテーション付きデータに依存する他の教師付きおよびSSLベースラインと比較して、ゼロショット分類によるアノテーション付きデータを使用することなく、約10%のパフォーマンス改善を達成する。
さらに、MIT-BIHはトレーニング済みのデータセットと比較して、ECGの異なるクラスを含むにもかかわらず、METSはMIT-BIHデータセット上で最高のリコールとF1スコアを達成する。
広範な実験により、一般化可能性、有効性、効率性の観点からecg-text multimodal self-supervised learningの利点が実証された。
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