論文の概要: Unsupervised Brain Tumor Segmentation with Image-based Prompts
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.01472v1
- Date: Tue, 4 Apr 2023 02:28:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-04-05 15:43:48.420084
- Title: Unsupervised Brain Tumor Segmentation with Image-based Prompts
- Title(参考訳): 画像ベースプロンプトを用いた無監督脳腫瘍切除
- Authors: Xinru Zhang, Ni Ou, Chenghao Liu, Zhizheng Zhuo, Yaou Liu, and Chuyang
Ye
- Abstract要約: 我々は,脳腫瘍の診断を可能にする画像ベースのプロンプトを設計し,教師なし脳腫瘍セグメンテーションへのアプローチを提案する。
大量の注釈付きデータで脳腫瘍セグメンテーションのモデルを直接訓練する代わりに、私たちは質問に答えられるモデルをトレーニングしようとしています。
手作りのデザインは、あらゆる種類の実際の腫瘍を表現するには単純すぎるため、訓練されたモデルは、実際には異常の問題に答えるのではなく、単純化された手作りのタスクに過度に適合する可能性がある。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.525656002678856
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automated brain tumor segmentation based on deep learning (DL) has achieved
promising performance. However, it generally relies on annotated images for
model training, which is not always feasible in clinical settings. Therefore,
the development of unsupervised DL-based brain tumor segmentation approaches
without expert annotations is desired. Motivated by the success of prompt
learning (PL) in natural language processing, we propose an approach to
unsupervised brain tumor segmentation by designing image-based prompts that
allow indication of brain tumors, and this approach is dubbed as PL-based Brain
Tumor Segmentation (PL-BTS). Specifically, instead of directly training a model
for brain tumor segmentation with a large amount of annotated data, we seek to
train a model that can answer the question: is a voxel in the input image
associated with tumor-like hyper-/hypo-intensity? Such a model can be trained
by artificially generating tumor-like hyper-/hypo-intensity on images without
tumors with hand-crafted designs. Since the hand-crafted designs may be too
simplistic to represent all kinds of real tumors, the trained model may overfit
the simplistic hand-crafted task rather than actually answer the question of
abnormality. To address this problem, we propose the use of a validation task,
where we generate a different hand-crafted task to monitor overfitting. In
addition, we propose PL-BTS+ that further improves PL-BTS by exploiting
unannotated images with brain tumors. Compared with competing unsupervised
methods, the proposed method has achieved marked improvements on both public
and in-house datasets, and we have also demonstrated its possible extension to
other brain lesion segmentation tasks.
- Abstract(参考訳): 深層学習(DL)に基づく自動脳腫瘍セグメンテーションは有望な性能を達成した。
しかし、一般的には、モデルトレーニングのための注釈付き画像に依存しており、臨床環境では必ずしも実現できない。
したがって、専門家の注記を伴わない無監督のdlベース脳腫瘍分画法の開発が望まれる。
自然言語処理におけるプロンプト学習(PL)の成功により,脳腫瘍の表示を可能にする画像ベースのプロンプトを設計し,教師なし脳腫瘍セグメンテーションへのアプローチを提案し,このアプローチをPLベースの脳腫瘍セグメンテーション(PL-BTS)と呼ぶ。
具体的には、大量の注釈付きデータで脳腫瘍セグメンテーションのモデルを直接訓練する代わりに、疑問に答えられるモデル、すなわち腫瘍様のハイパー/ハイポインテンシティに関連する入力画像のボクセルをトレーニングする。
このようなモデルは、手作りのデザインの腫瘍を伴わずに、画像上に腫瘍様高/ハイポ強度を人工的に生成することで訓練することができる。
手作りのデザインは、あらゆる種類の実際の腫瘍を表現できないほど単純すぎるため、訓練されたモデルは、実際に異常の質問に答えるよりも、単純化された手作りのタスクに過剰に適合する可能性がある。
この問題に対処するため,我々は,オーバーフィッティングを監視するために手作りの異なるタスクを生成するバリデーションタスクを提案する。
また,脳腫瘍の未診断画像を利用したPL-BTS+を提案する。
競合する教師なし手法と比較して,提案手法はパブリックデータセットと社内データセットの両方において顕著な改善を達成しており,他の脳病変セグメンテーションタスクへの拡張の可能性も示している。
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