論文の概要: Causal Discovery with Stage Variables for Health Time Series
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.03662v1
- Date: Fri, 5 May 2023 16:30:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-08 13:14:04.118530
- Title: Causal Discovery with Stage Variables for Health Time Series
- Title(参考訳): 健康時系列のステージ変数による因果発見
- Authors: Bharat Srikishan and Samantha Kleinberg
- Abstract要約: Causal Discovery with Stage Variables (CDSV)は、ステージ変数を使用して複数の時系列からのデータを重み付けし、ステージ毎に異なる因果関係を説明できる。
シミュレーションデータでは、CDSVはベースラインに比べて偽の発見が少なく、eICUではベースラインよりもFDRが低く、MIMIC-IIIでは高血圧の臨床的に関係のある原因を発見できる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.0712335337791288
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Using observational data to learn causal relationships is essential when
randomized experiments are not possible, such as in healthcare. Discovering
causal relationships in time-series health data is even more challenging when
relationships change over the course of a disease, such as medications that are
most effective early on or for individuals with severe disease. Stage variables
such as weeks of pregnancy, disease stages, or biomarkers like HbA1c, can
influence what causal relationships are true for a patient. However, causal
inference within each stage is often not possible due to limited amounts of
data, and combining all data risks incorrect or missed inferences. To address
this, we propose Causal Discovery with Stage Variables (CDSV), which uses stage
variables to reweight data from multiple time-series while accounting for
different causal relationships in each stage. In simulated data, CDSV discovers
more causes with fewer false discoveries compared to baselines, in eICU it has
a lower FDR than baselines, and in MIMIC-III it discovers more clinically
relevant causes of high blood pressure.
- Abstract(参考訳): 医療などランダムな実験ができない場合には、観察データを使って因果関係を学習することが不可欠である。
時系列の健康データから因果関係を発見することは、重篤な疾患の患者に最も効果のある薬など、疾患の経過とともに関係が変化する場合にさらに困難である。
妊娠の週、病期、hba1cのようなバイオマーカーなどのステージ変数は、患者にとって因果関係が何であるかに影響を与える可能性がある。
しかし、各段階での因果推論は、データ量が限られているためしばしば不可能であり、すべてのデータリスクが不正または欠落した推論と組み合わせられる。
そこで本研究では,ステージ変数を用いて複数の時系列データの重み付けを行い,各ステージの因果関係を考慮に入れたCausal Discovery with Stage Variables(CDSV)を提案する。
シミュレーションデータでは、CDSVはベースラインに比べて偽の発見が少なく、eICUではベースラインよりもFDRが低く、MIMIC-IIIでは高血圧の臨床的に関係のある原因を発見できる。
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