論文の概要: PTGB: Pre-Train Graph Neural Networks for Brain Network Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.14376v1
- Date: Sat, 20 May 2023 21:07:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-26 00:32:56.748750
- Title: PTGB: Pre-Train Graph Neural Networks for Brain Network Analysis
- Title(参考訳): ptgb:脳ネットワーク解析のための事前学習グラフニューラルネットワーク
- Authors: Yi Yang, Hejie Cui, Carl Yang
- Abstract要約: 臨床結果に関係なく,脳内ネットワーク構造をキャプチャするGNN事前学習フレームワークPTGBを提案する。
PTGBは,(1)脳ネットワークに特化して設計された教師なし事前学習技術で,タスク固有のラベルを持たない大規模データセットからの学習を可能にすること,(2)異なるROIシステムを持つデータセット間の知識伝達を容易にするデータ駆動型パーセルレーションアトラスマッピングパイプラインである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 39.16619345610152
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The human brain is the central hub of the neurobiological system, controlling
behavior and cognition in complex ways. Recent advances in neuroscience and
neuroimaging analysis have shown a growing interest in the interactions between
brain regions of interest (ROIs) and their impact on neural development and
disorder diagnosis. As a powerful deep model for analyzing graph-structured
data, Graph Neural Networks (GNNs) have been applied for brain network
analysis. However, training deep models requires large amounts of labeled data,
which is often scarce in brain network datasets due to the complexities of data
acquisition and sharing restrictions. To make the most out of available
training data, we propose PTGB, a GNN pre-training framework that captures
intrinsic brain network structures, regardless of clinical outcomes, and is
easily adaptable to various downstream tasks. PTGB comprises two key
components: (1) an unsupervised pre-training technique designed specifically
for brain networks, which enables learning from large-scale datasets without
task-specific labels; (2) a data-driven parcellation atlas mapping pipeline
that facilitates knowledge transfer across datasets with different ROI systems.
Extensive evaluations using various GNN models have demonstrated the robust and
superior performance of PTGB compared to baseline methods.
- Abstract(参考訳): 人間の脳は神経生物学的システムの中心であり、複雑な方法で行動や認知を制御する。
神経科学と神経画像解析の最近の進歩は、関心の脳領域(ROI)間の相互作用と、その神経発達と障害の診断に対する影響への関心が高まっている。
グラフ構造データ解析のための強力な深層モデルとして、グラフニューラルネットワーク(gnns)が脳ネットワーク解析に応用されている。
しかしながら、深層モデルのトレーニングには大量のラベル付きデータが必要であり、データ取得と共有制限の複雑さのため、ブレインネットワークデータセットでは不足することが多い。
利用可能なトレーニングデータを最大限に活用するために,本研究では,臨床結果に関係なく内在的な脳ネットワーク構造をキャプチャし,さまざまな下流タスクに容易に適応可能な,gnn事前トレーニングフレームワークptgbを提案する。
PTGBは,(1)タスク固有のラベルを持たない大規模データセットから学習が可能な,脳ネットワーク用に設計された教師なし事前学習技術,(2)異なるROIシステムを持つデータセット間の知識伝達を容易にするデータ駆動型解析アトラスマッピングパイプラインである。
各種GNNモデルを用いた大規模評価は,ベースライン法と比較してPTGBの頑健かつ優れた性能を示した。
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