論文の概要: GRU-D-Weibull: A Novel Real-Time Individualized Endpoint Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.07452v1
- Date: Mon, 14 Aug 2023 20:46:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-16 14:50:45.411827
- Title: GRU-D-Weibull: A Novel Real-Time Individualized Endpoint Prediction
- Title(参考訳): GRU-D-Weibull:新しいリアルタイム個別エンドポイント予測
- Authors: Xiaoyang Ruan, Liwei Wang, Charat Thongprayoon, Wisit Cheungpasitporn,
Hongfang Liu
- Abstract要約: ワイブル分布をモデル化するために、ゲート再帰単位と崩壊(GRU-D)を組み合わせた新しいアプローチGRU-D-Weibullを提案する。
4期慢性腎臓病(CKD4)6,879例のコホートを用いて,GRU-D-Weibullの終末予測成績を検討した。
提案手法はCKD4指数で1.1年(SD 0.95)、フォローアップ4年で0.45年(SD0.3)の絶対L1損失を達成し,競合法よりも有意に優れていた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.871599399011306
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Accurate prediction models for individual-level endpoints and
time-to-endpoints are crucial in clinical practice. In this study, we propose a
novel approach, GRU-D-Weibull, which combines gated recurrent units with decay
(GRU-D) to model the Weibull distribution. Our method enables real-time
individualized endpoint prediction and population-level risk management. Using
a cohort of 6,879 patients with stage 4 chronic kidney disease (CKD4), we
evaluated the performance of GRU-D-Weibull in endpoint prediction. The C-index
of GRU-D-Weibull was ~0.7 at the index date and increased to ~0.77 after 4.3
years of follow-up, similar to random survival forest. Our approach achieved an
absolute L1-loss of ~1.1 years (SD 0.95) at the CKD4 index date and a minimum
of ~0.45 years (SD0.3) at 4 years of follow-up, outperforming competing methods
significantly. GRU-D-Weibull consistently constrained the predicted survival
probability at the time of an event within a smaller and more fixed range
compared to other models throughout the follow-up period. We observed
significant correlations between the error in point estimates and missing
proportions of input features at the index date (correlations from ~0.1 to
~0.3), which diminished within 1 year as more data became available. By
post-training recalibration, we successfully aligned the predicted and observed
survival probabilities across multiple prediction horizons at different time
points during follow-up. Our findings demonstrate the considerable potential of
GRU-D-Weibull as the next-generation architecture for endpoint risk management,
capable of generating various endpoint estimates for real-time monitoring using
clinical data.
- Abstract(参考訳): 個別のエンドポイントとエンドポイントの正確な予測モデルは、臨床実践において不可欠である。
本研究では,ゲートリカレント単位と崩壊(gru-d)を結合し,ワイブル分布をモデル化する新しいアプローチ gru-d-weibull を提案する。
本手法は,リアルタイムの個別化エンドポイント予測と集団レベルのリスク管理を可能にする。
4期慢性腎臓病(CKD4)6,879例のコホートを用いて,GRU-D-Weibullの終末予測成績を検討した。
GRU-D-WeibullのC-インデックスは指数日時点で ~0.7 であり、無作為生存林と同様の4.3年後には ~0.77 に増加した。
提案手法はCKD4指数において絶対L1-loss ~1.1年 (SD 0.95) を達成し,4年後のSD0.3 を最小0.45年 (SD0.3) とした。
GRU-D-Weibullは、フォローアップ期間を通じて他のモデルと比較して、より小さく、より固定された範囲でイベント発生時の予測生存確率を一貫して制限した。
点推定誤差と指標日における入力特徴の欠落率(0.1~0.3の相関)との間に有意な相関関係がみられ,より多くのデータが利用可能になるにつれて1年以内に減少していた。
トレーニング後の再調整により,複数の予測地平線にまたがって予測・観測された生存確率をフォローアップ中に一致させた。
以上の結果から,gru-d-weibullはエンドポイントリスク管理のための次世代アーキテクチャとして,臨床データを用いたリアルタイムモニタリングのために様々なエンドポイント推定を生成できる可能性が示唆された。
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