論文の概要: CryoAlign: feature-based method for global and local 3D alignment of EM density maps

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.09217v1
• Date: Sun, 17 Sep 2023 09:07:57 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2023-09-19 16:52:26.324461
• Title: CryoAlign: feature-based method for global and local 3D alignment of EM density maps
• Title（参考訳）: cryoalign:em密度マップのグローバルおよびローカル3次元アライメントのための特徴量に基づく手法
• Authors: Bintao He, Fa Zhang, Chenjie Feng, Jianyi Yang, Xin Gao and Renmin Han
• Abstract要約: 我々は,CryoAlignの高速かつ高精度な局所電子顕微鏡密度マップアライメント法を提案する。 C CryoAlignは、機能ベースのEMマップアライメントツールであり、機能ベースのアーキテクチャを使うことで、ポイントペア対応の迅速な確立を可能にする。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 22.748115335755756
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Advances on cryo-electron imaging technologies have led to a rapidly increasing number of density maps. Alignment and comparison of density maps play a crucial role in interpreting structural information, such as conformational heterogeneity analysis using global alignment and atomic model assembly through local alignment. Here, we propose a fast and accurate global and local cryo-electron microscopy density map alignment method CryoAlign, which leverages local density feature descriptors to capture spatial structure similarities. CryoAlign is the first feature-based EM map alignment tool, in which the employment of feature-based architecture enables the rapid establishment of point pair correspondences and robust estimation of alignment parameters. Extensive experimental evaluations demonstrate the superiority of CryoAlign over the existing methods in both alignment accuracy and speed.
• Abstract（参考訳）: 低温電子イメージング技術の進歩により、密度マップが急速に増加した。 密度マップのアライメントと比較は、大域的アライメントを用いたコンフォメーション不均一解析や局所的アライメントによる原子モデルアセンブリといった構造情報の解釈において重要な役割を果たす。 本稿では,局所密度特徴記述子を用いて空間構造の類似性を捉えた,高速かつ高精度な全球・局所核電顕密度マップアライメント手法であるcryoalignを提案する。 CryoAlignは機能ベースのEMマップアライメントツールであり、機能ベースのアーキテクチャを使うことで、ポイントペア対応の迅速な確立とアライメントパラメータのロバストな推定が可能になる。 CryoAlignはアライメント精度と速度の両方で既存の手法よりも優れていることを示す。

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