論文の概要: Clinical Trial Recommendations Using Semantics-Based Inductive Inference
and Knowledge Graph Embeddings
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.15979v1
- Date: Wed, 27 Sep 2023 19:54:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-09-29 18:57:25.690748
- Title: Clinical Trial Recommendations Using Semantics-Based Inductive Inference
and Knowledge Graph Embeddings
- Title(参考訳): 意味論的推論と知識グラフ埋め込みを用いた臨床試験
- Authors: Murthy V. Devarakonda, Smita Mohanty, Raja Rao Sunkishala, Nag
Mallampalli, and Xiong Liu
- Abstract要約: 本稿では,臨床治験の知識グラフに基づいて学習した神経埋め込みに基づく新しい勧告手法を提案する。
以上の結果から,本提案手法は実際の臨床試験とテキストの類似性から,70%~83%の関連性スコアを達成できた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Designing a new clinical trial entails many decisions, such as defining a
cohort and setting the study objectives to name a few, and therefore can
benefit from recommendations based on exhaustive mining of past clinical trial
records. Here, we propose a novel recommendation methodology, based on neural
embeddings trained on a first-of-a-kind knowledge graph of clinical trials. We
addressed several important research questions in this context, including
designing a knowledge graph (KG) for clinical trial data, effectiveness of
various KG embedding (KGE) methods for it, a novel inductive inference using
KGE, and its use in generating recommendations for clinical trial design. We
used publicly available data from clinicaltrials.gov for the study. Results
show that our recommendations approach achieves relevance scores of 70%-83%,
measured as the text similarity to actual clinical trial elements, and the most
relevant recommendation can be found near the top of list. Our study also
suggests potential improvement in training KGE using node semantics.
- Abstract(参考訳): 新しい臨床試験を設計するには、コホートの定義や研究目標の設定など、多くの決定が必要であるため、過去の臨床試験記録の徹底的なマイニングに基づく推奨の恩恵を受けることができる。
本稿では,臨床試験の最初の知識グラフで学習した神経組込みに基づく新しい推薦手法を提案する。
本研究は, 臨床試験データのための知識グラフ(kg)の設計, 各種kg埋め込み法(kge)の有効性, kgeを用いた新しい帰納的推論法, 臨床試験設計のための勧告作成におけるその活用など, 重要な研究課題に対処した。
この研究には、臨床試験の公開データを用いた。
以上の結果から,提案手法は,実際の治験要素のテキスト類似度として測定された70%-83%の妥当性スコアを達成し,最も関連性の高い推奨項目をリストの最上位に示すことができる。
本研究は,ノードセマンティクスを用いたKGEトレーニングの改善の可能性についても示唆した。
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