論文の概要: SWoTTeD: An Extension of Tensor Decomposition to Temporal Phenotyping
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.01201v1
- Date: Mon, 2 Oct 2023 13:42:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-04 21:40:08.286502
- Title: SWoTTeD: An Extension of Tensor Decomposition to Temporal Phenotyping
- Title(参考訳): swotted:テンソル分解から時間表現型への拡張
- Authors: Hana Sebia, Thomas Guyet, Etienne Audureau
- Abstract要約: 隠れ時間パターンを発見する新しい手法SWoTTeD(Sliding Window for Temporal Decomposition)を提案する。
我々は, 合成と実世界の両方のデータセットを用いて提案手法を検証し, パリ大病院のデータを用いた独自のユースケースを提案する。
その結果、SWoTTeDは最近の最先端テンソル分解モデルと同程度の精度で再現可能であることがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Tensor decomposition has recently been gaining attention in the machine
learning community for the analysis of individual traces, such as Electronic
Health Records (EHR). However, this task becomes significantly more difficult
when the data follows complex temporal patterns. This paper introduces the
notion of a temporal phenotype as an arrangement of features over time and it
proposes SWoTTeD (Sliding Window for Temporal Tensor Decomposition), a novel
method to discover hidden temporal patterns. SWoTTeD integrates several
constraints and regularizations to enhance the interpretability of the
extracted phenotypes. We validate our proposal using both synthetic and
real-world datasets, and we present an original usecase using data from the
Greater Paris University Hospital. The results show that SWoTTeD achieves at
least as accurate reconstruction as recent state-of-the-art tensor
decomposition models, and extracts temporal phenotypes that are meaningful for
clinicians.
- Abstract(参考訳): テンソル分解は最近、電子健康記録(ehr)のような個々のトレースの分析のために機械学習コミュニティで注目を集めている。
しかし、データが複雑な時間パターンに従うと、このタスクは大幅に難しくなる。
本稿では,時間的特徴の配置として時相表現型の概念を導入し,隠れた時相パターンを探索する新しい手法であるswotted(sliding window for temporal tensor decomposition)を提案する。
swottedは、抽出された表現型の解釈性を高めるために、いくつかの制約と正規化を統合する。
本提案は,合成データと実世界データの両方を用いて検証し,大パリ大学病院のデータを用いた独自のユースケースを提案する。
その結果, SWoTTeDは最近のテンソル分解モデルと同等の精度で再現でき, 臨床医にとって有意義な時間的表現型を抽出できることがわかった。
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