論文の概要: Interpretable factorization of clinical questionnaires to identify
latent factors of psychopathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.07762v1
- Date: Tue, 12 Dec 2023 22:10:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-12-14 17:23:12.963443
- Title: Interpretable factorization of clinical questionnaires to identify
latent factors of psychopathology
- Title(参考訳): 精神病理の潜伏因子同定のための臨床アンケートの解釈因子化
- Authors: Ka Chun Lam, Bridget W Mahony, Armin Raznahan, Francisco Pereira
- Abstract要約: 質問紙データに適した非負行列因子化法であるICQF(Interpretability constrained Question Factorization)を導入する。
ICQFは、さまざまな障害の診断情報を保存しながら、ドメインの専門家によって定義された解釈可能性を改善する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.9051761801489249
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Psychiatry research seeks to understand the manifestations of psychopathology
in behavior, as measured in questionnaire data, by identifying a small number
of latent factors that explain them. While factor analysis is the traditional
tool for this purpose, the resulting factors may not be interpretable, and may
also be subject to confounding variables. Moreover, missing data are common,
and explicit imputation is often required. To overcome these limitations, we
introduce interpretability constrained questionnaire factorization (ICQF), a
non-negative matrix factorization method with regularization tailored for
questionnaire data. Our method aims to promote factor interpretability and
solution stability. We provide an optimization procedure with theoretical
convergence guarantees, and an automated procedure to detect latent
dimensionality accurately. We validate these procedures using realistic
synthetic data. We demonstrate the effectiveness of our method in a widely used
general-purpose questionnaire, in two independent datasets (the Healthy Brain
Network and Adolescent Brain Cognitive Development studies). Specifically, we
show that ICQF improves interpretability, as defined by domain experts, while
preserving diagnostic information across a range of disorders, and outperforms
competing methods for smaller dataset sizes. This suggests that the
regularization in our method matches domain characteristics. The python
implementation for ICQF is available at
\url{https://github.com/jefferykclam/ICQF}.
- Abstract(参考訳): 精神医学研究は、少数の潜在要因を同定し、アンケートデータで測定された行動における精神病理学の症状を理解することを目的としている。
因子分析は、この目的のために伝統的なツールであるが、結果の因子は解釈できない可能性があり、また変数を導出することもある。
さらに、データの欠落は一般的であり、明示的なインプテーションがしばしば必要となる。
これらの制約を克服するために,非負の行列因子化法であるicqf(constructionaled questionnaire factorization)を提案する。
本手法は,因子解釈可能性と解安定性の促進を目的とする。
理論的収束保証を備えた最適化手法と、遅延次元を正確に検出する自動手順を提供する。
これらの手順を現実的な合成データを用いて検証する。
本手法は,健康的脳ネットワークと青年期脳認知発達研究の2つの独立したデータセットにおいて,広く用いられている汎用質問票において有効であることを示す。
具体的には、ICQFは、さまざまな障害の診断情報を保存しながら、ドメインの専門家によって定義された解釈可能性を改善し、より小さなデータセットサイズで競合する手法より優れていることを示す。
これは,本手法の正規化が領域特性と一致することを示唆している。
ICQF のpython実装は \url{https://github.com/jefferykclam/ICQF} で利用可能である。
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