論文の概要: Self-supervised Visualisation of Medical Image Datasets
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2402.14566v2
- Date: Wed, 24 Jul 2024 21:52:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-26 19:26:49.280314
- Title: Self-supervised Visualisation of Medical Image Datasets
- Title(参考訳): 医用画像データセットの自己教師型可視化
- Authors: Ifeoma Veronica Nwabufo, Jan Niklas Böhm, Philipp Berens, Dmitry Kobak,
- Abstract要約: 自己教師付き学習法である$t$-SimCNEは、コントラスト学習を用いて、視覚化に適した2D表現を直接訓練する。
本研究では、皮膚科学、組織学、血液顕微鏡などの医療画像データセットの可視化に$t$-SimCNEを使用しました。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.05427848112207
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Self-supervised learning methods based on data augmentations, such as SimCLR, BYOL, or DINO, allow obtaining semantically meaningful representations of image datasets and are widely used prior to supervised fine-tuning. A recent self-supervised learning method, $t$-SimCNE, uses contrastive learning to directly train a 2D representation suitable for visualisation. When applied to natural image datasets, $t$-SimCNE yields 2D visualisations with semantically meaningful clusters. In this work, we used $t$-SimCNE to visualise medical image datasets, including examples from dermatology, histology, and blood microscopy. We found that increasing the set of data augmentations to include arbitrary rotations improved the results in terms of class separability, compared to data augmentations used for natural images. Our 2D representations show medically relevant structures and can be used to aid data exploration and annotation, improving on common approaches for data visualisation.
- Abstract(参考訳): SimCLR、BYOL、DINOなどのデータ拡張に基づく自己教師付き学習手法により、画像データセットの意味論的意味のある表現が得られ、教師付き微調整の前に広く使用される。
最近の自己教師型学習手法である$t$-SimCNEは、コントラスト学習を用いて、視覚化に適した2D表現を直接訓練する。
自然画像データセットに適用すると、$t$-SimCNEは意味論的に意味のあるクラスタを持つ2Dヴィジュアライゼーションが得られる。
本研究では、皮膚科学、組織学、血液顕微鏡などの医療画像データセットの可視化に$t$-SimCNEを使用しました。
その結果、任意の回転を含むデータ拡張の集合の増加は、自然画像に使用されるデータ拡張と比較して、クラス分離性の観点から結果を改善した。
我々の2D表現は、医学的に関係のある構造を示し、データ探索とアノテーションを補助し、データの可視化のための一般的なアプローチを改善するために使用することができる。
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