論文の概要: Guidelines for Cerebrovascular Segmentation: Managing Imperfect Annotations in the context of Semi-Supervised Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2404.01765v1
- Date: Tue, 2 Apr 2024 09:31:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-04-03 17:09:01.476970
- Title: Guidelines for Cerebrovascular Segmentation: Managing Imperfect Annotations in the context of Semi-Supervised Learning
- Title(参考訳): 脳血管のセグメンテーションに関するガイドライン:半監督学習の文脈における不完全アノテーションの管理
- Authors: Pierre Rougé, Pierre-Henri Conze, Nicolas Passat, Odyssée Merveille,
- Abstract要約: 教師付き学習法は、十分な量のラベル付きデータを入力した場合に優れた性能を達成する。
このようなラベルは一般的に、非常に時間がかかり、エラーが発生し、製造コストがかかる。
半教師付き学習アプローチはラベル付きデータとラベルなしデータの両方を活用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.231698506153459
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Segmentation in medical imaging is an essential and often preliminary task in the image processing chain, driving numerous efforts towards the design of robust segmentation algorithms. Supervised learning methods achieve excellent performances when fed with a sufficient amount of labeled data. However, such labels are typically highly time-consuming, error-prone and expensive to produce. Alternatively, semi-supervised learning approaches leverage both labeled and unlabeled data, and are very useful when only a small fraction of the dataset is labeled. They are particularly useful for cerebrovascular segmentation, given that labeling a single volume requires several hours for an expert. In addition to the challenge posed by insufficient annotations, there are concerns regarding annotation consistency. The task of annotating the cerebrovascular tree is inherently ambiguous. Due to the discrete nature of images, the borders and extremities of vessels are often unclear. Consequently, annotations heavily rely on the expert subjectivity and on the underlying clinical objective. These discrepancies significantly increase the complexity of the segmentation task for the model and consequently impair the results. Consequently, it becomes imperative to provide clinicians with precise guidelines to improve the annotation process and construct more uniform datasets. In this article, we investigate the data dependency of deep learning methods within the context of imperfect data and semi-supervised learning, for cerebrovascular segmentation. Specifically, this study compares various state-of-the-art semi-supervised methods based on unsupervised regularization and evaluates their performance in diverse quantity and quality data scenarios. Based on these experiments, we provide guidelines for the annotation and training of cerebrovascular segmentation models.
- Abstract(参考訳): 医用画像のセグメンテーションは画像処理チェーンにおいて必須であり、しばしば予備的な課題であり、ロバストなセグメンテーションアルゴリズムの設計に向けた多くの取り組みを推進している。
教師付き学習法は、十分な量のラベル付きデータを入力した場合に優れた性能を達成する。
しかし、そのようなラベルは通常、非常に時間がかかり、エラーが発生し、製造コストがかかる。
あるいは、半教師付き学習アプローチはラベル付きデータとラベルなしデータの両方を活用する。
特に脳血管のセグメンテーションには有用であり、単一のボリュームのラベル付けには専門家に数時間を要する。
アノテーション不足による課題に加えて、アノテーションの一貫性に関する懸念もある。
脳血管樹のアノテートは本質的に曖昧である。
画像の独立した性質のため、船舶の境界線や極端線はしばしば不明瞭である。
その結果、アノテーションは専門家の主観性と根底にある臨床目的に大きく依存している。
これらの相違は、モデルのセグメンテーションタスクの複雑さを著しく増加させ、その結果を損なう。
したがって、アノテーションプロセスを改善し、より均一なデータセットを構築するために、臨床医に正確なガイドラインを提供することが義務づけられる。
本稿では,脳血管セグメンテーションにおける不完全データと半教師付き学習の文脈における深層学習手法のデータ依存性について検討する。
具体的には、教師なし正規化に基づく最先端の半教師あり手法を比較し、多種多様な量と品質データシナリオでそれらの性能を評価する。
これらの実験に基づいて、脳血管セグメンテーションモデルのアノテーションとトレーニングのガイドラインを提供する。
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