論文の概要: DIRI: Adversarial Patient Reidentification with Large Language Models for Evaluating Clinical Text Anonymization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.17035v1
- Date: Tue, 22 Oct 2024 14:06:31 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-10-23 14:25:41.273255
- Title: DIRI: Adversarial Patient Reidentification with Large Language Models for Evaluating Clinical Text Anonymization
- Title(参考訳): DIRI:臨床テキスト匿名化評価のための大規模言語モデルによる患者再同定
- Authors: John X. Morris, Thomas R. Campion, Sri Laasya Nutheti, Yifan Peng, Akhil Raj, Ramin Zabih, Curtis L. Cole,
- Abstract要約: 本研究は, 大規模言語モデルを用いて患者を同定し, 臨床記録の再検討を行った。
本手法は, 臨床診断書に適合する患者を同定するために, 大規模言語モデルを用いている。
ClinicalBERTが最も有効であり, マスキングでPIIが同定できたが, 臨床記録の9%は再同定された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.038800602897354
- License:
- Abstract: Sharing protected health information (PHI) is critical for furthering biomedical research. Before data can be distributed, practitioners often perform deidentification to remove any PHI contained in the text. Contemporary deidentification methods are evaluated on highly saturated datasets (tools achieve near-perfect accuracy) which may not reflect the full variability or complexity of real-world clinical text and annotating them is resource intensive, which is a barrier to real-world applications. To address this gap, we developed an adversarial approach using a large language model (LLM) to re-identify the patient corresponding to a redacted clinical note and evaluated the performance with a novel De-Identification/Re-Identification (DIRI) method. Our method uses a large language model to reidentify the patient corresponding to a redacted clinical note. We demonstrate our method on medical data from Weill Cornell Medicine anonymized with three deidentification tools: rule-based Philter and two deep-learning-based models, BiLSTM-CRF and ClinicalBERT. Although ClinicalBERT was the most effective, masking all identified PII, our tool still reidentified 9% of clinical notes Our study highlights significant weaknesses in current deidentification technologies while providing a tool for iterative development and improvement.
- Abstract(参考訳): 保護された健康情報(PHI)の共有は、生物医学研究の促進に不可欠である。
データが配布される前に、実践者はテキストに含まれる任意のPHIを削除するために識別を行うことが多い。
高度に飽和したデータセット(ツールがほぼ完璧な精度を達成している)では,実際の臨床テキストの完全変動や複雑さを反映せず,それらに注釈を付けることは資源集約的であり,現実の応用の障壁となる。
このギャップに対処するため, 大規模言語モデル (LLM) を用いて患者を再同定し, 新規な診断・再同定法(DIRI) を用いて評価した。
本手法は, 臨床診断書に適合する患者を同定するために, 大規模言語モデルを用いている。
本稿では,ルールベースPhilterと深層学習モデル,BiLSTM-CRFとCeriorBERTの3つの匿名化ツールを用いたWeill Cornell Medicineの医療データについて紹介する。
臨床検査はPIIをマスキングするのが最も効果的であったが, 臨床検査の9%はいまだに再同定されており, 現段階での診断技術に重大な弱点がみられ, 反復的開発と改善のためのツールが提供された。
関連論文リスト
- Clinical Evaluation of Medical Image Synthesis: A Case Study in Wireless Capsule Endoscopy [63.39037092484374]
本研究は,人工知能(AI)モデルを用いた医用合成データ生成の臨床評価に焦点を当てた。
本論文は,a) 医用専門家による合成画像の体系的評価のためのプロトコルを提示し,b) 高分解能WCE画像合成のための新しい変分オートエンコーダモデルであるTIDE-IIを評価する。
その結果、TIDE-IIは臨床的に関連性のあるWCE画像を生成し、データの不足に対処し、診断ツールの強化に役立つことがわかった。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-10-31T19:48:50Z) - DeIDClinic: A Multi-Layered Framework for De-identification of Clinical Free-text Data [6.473402241020136]
本研究は,臨床テキストを微調整した深層学習モデルであるCeriorBERTを統合することにより,MASKフレームワークを強化する。
このシステムは、臨床文書内の機密性のある実体を効果的に識別し、再認識するか、置き換える。
リスク評価機能も開発され、文書内のコンテキストのユニークさを分析してリスクレベルに分類する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-10-02T15:16:02Z) - Improving Clinical Note Generation from Complex Doctor-Patient Conversation [20.2157016701399]
大言語モデル(LLM)を用いた臨床ノート作成分野への3つの重要な貢献について述べる。
まず、CliniKnoteを紹介します。CliniKnoteは、1200の複雑な医師と患者との会話と、その全臨床ノートを組み合わせたデータセットです。
第2に,従来のSOAPcitepodder20soap(Subjective, Objective, Assessment, Plan)のメモを上位にキーワードセクションを追加することで,必須情報の迅速な識別を可能にするK-SOAPを提案する。
第3に、医師と患者との会話からK-SOAPノートを生成する自動パイプラインを開発し、様々な近代LCMをベンチマークする。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-08-26T18:39:31Z) - Self-Verification Improves Few-Shot Clinical Information Extraction [73.6905567014859]
大規模言語モデル (LLMs) は、数発のテキスト内学習を通じて臨床キュレーションを加速する可能性を示している。
正確性や解釈可能性に関する問題、特に健康のようなミッションクリティカルな領域ではまだ苦戦している。
本稿では,自己検証を用いた汎用的な緩和フレームワークについて検討する。このフレームワークはLLMを利用して,自己抽出のための証明を提供し,その出力をチェックする。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-05-30T22:05:11Z) - Development and validation of a natural language processing algorithm to
pseudonymize documents in the context of a clinical data warehouse [53.797797404164946]
この研究は、この領域でツールやリソースを共有する際に直面する困難を浮き彫りにしている。
臨床文献のコーパスを12種類に分類した。
私たちは、ディープラーニングモデルと手動ルールの結果をマージして、ハイブリッドシステムを構築します。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-03-23T17:17:46Z) - sEHR-CE: Language modelling of structured EHR data for efficient and
generalizable patient cohort expansion [0.0]
sEHR-CEは、異種臨床データセットの統合表現型化と分析を可能にするトランスフォーマーに基づく新しいフレームワークである。
大規模研究である英国バイオバンクのプライマリ・セカンダリ・ケアデータを用いてアプローチを検証する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-11-30T16:00:43Z) - Classifying Cyber-Risky Clinical Notes by Employing Natural Language
Processing [9.77063694539068]
近年、アメリカ合衆国内の一部の州では、患者が臨床ノートに自由にアクセスできるように求めている。
本研究は,臨床ノートにおけるセキュリティ・プライバシリスクの特定方法について検討する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-03-24T00:36:59Z) - Towards more patient friendly clinical notes through language models and
ontologies [57.51898902864543]
本稿では,単語の単純化と言語モデリングに基づく医療用テキストの自動作成手法を提案する。
我々は,公開医療文のデータセットペアと,臨床医による簡易化版を用いている。
本手法は,医学フォーラムデータに基づく言語モデルを用いて,文法と本来の意味の両方を保存しながら,より単純な文を生成する。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-12-23T16:11:19Z) - Self-supervised Answer Retrieval on Clinical Notes [68.87777592015402]
本稿では,ドメイン固有パスマッチングのためのトランスフォーマー言語モデルをトレーニングするためのルールベースのセルフスーパービジョンであるCAPRを紹介する。
目的をトランスフォーマーベースの4つのアーキテクチャ、コンテキスト文書ベクトル、ビ-、ポリエンコーダ、クロスエンコーダに適用する。
本稿では,ドメイン固有パスの検索において,CAPRが強いベースラインを上回り,ルールベースおよび人間ラベル付きパスを効果的に一般化することを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-08-02T10:42:52Z) - Benchmarking Automated Clinical Language Simplification: Dataset,
Algorithm, and Evaluation [48.87254340298189]
我々はMedLaneという名の新しいデータセットを構築し、自動化された臨床言語簡易化手法の開発と評価を支援する。
我々は,人間のアノテーションの手順に従い,最先端のパフォーマンスを実現するDECLAREと呼ばれる新しいモデルを提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-12-04T06:09:02Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。