論文の概要: PINNing Cerebral Blood Flow: Analysis of Perfusion MRI in Infants using Physics-Informed Neural Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.19759v1
- Date: Fri, 11 Oct 2024 15:07:04 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-03 08:19:48.361314
- Title: PINNing Cerebral Blood Flow: Analysis of Perfusion MRI in Infants using Physics-Informed Neural Networks
- Title(参考訳): PINNing 脳血流:物理インフォームドニューラルネットワークを用いた小児の灌流MRI解析
- Authors: Christoforos Galazis, Ching-En Chiu, Tomoki Arichi, Anil A. Bharath, Marta Varela,
- Abstract要約: ASL ( Arterial spin labeling) MRI (MRI) は脳血流計測を可能にする。
ASLを用いた幼児の脳血流推定は、ネットワーク生理学の複雑な相互作用により困難である。
幼児のASLデータからCBFや他のパラメータを推定するために,空間不確実性に基づく新しい物理インフォームドニューラルネットワーク(PINN, SUPINN)を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.5438681255766238
- License:
- Abstract: Arterial spin labeling (ASL) magnetic resonance imaging (MRI) enables cerebral perfusion measurement, which is crucial in detecting and managing neurological issues in infants born prematurely or after perinatal complications. However, cerebral blood flow (CBF) estimation in infants using ASL remains challenging due to the complex interplay of network physiology, involving dynamic interactions between cardiac output and cerebral perfusion, as well as issues with parameter uncertainty and data noise. We propose a new spatial uncertainty-based physics-informed neural network (PINN), SUPINN, to estimate CBF and other parameters from infant ASL data. SUPINN employs a multi-branch architecture to concurrently estimate regional and global model parameters across multiple voxels. It computes regional spatial uncertainties to weigh the signal. SUPINN can reliably estimate CBF (relative error $-0.3 \pm 71.7$), bolus arrival time (AT) ($30.5 \pm 257.8$), and blood longitudinal relaxation time ($T_{1b}$) ($-4.4 \pm 28.9$), surpassing parameter estimates performed using least squares or standard PINNs. Furthermore, SUPINN produces physiologically plausible spatially smooth CBF and AT maps. Our study demonstrates the successful modification of PINNs for accurate multi-parameter perfusion estimation from noisy and limited ASL data in infants. Frameworks like SUPINN have the potential to advance our understanding of the complex cardio-brain network physiology, aiding in the detection and management of diseases. Source code is provided at: https://github.com/cgalaz01/supinn.
- Abstract(参考訳): ASL ( Arterial spin labeling) MRI (MRI) は、新生児の周産期または周産期合併症を早期に検出および管理するために重要な脳血流計測を可能にする。
しかし、ASLを用いた幼児の脳血流量(CBF)の推定は、心臓出力と脳血流のダイナミックな相互作用、パラメータの不確実性やデータノイズの問題など、ネットワーク生理学の複雑な相互作用により、依然として困難である。
幼児のASLデータからCBFや他のパラメータを推定するために,空間不確実性に基づく新しい物理インフォームドニューラルネットワーク(PINN, SUPINN)を提案する。
SUPINNはマルチブランチアーキテクチャを用いて、複数のボクセルにまたがる地域モデルとグローバルモデルパラメータを同時に推定する。
信号の量を測定するために、地域空間の不確実性を計算する。
SUPINNはCBF(相対誤差$-0.3 \pm 71.7$)、ボーラス到着時間(AT)(30.5 \pm 257.8$)、血液長手緩和時間(T_{1b}$)(4.4 \pm 28.9$)を確実に推定でき、最小二乗または標準PINNを用いて実行されるパラメータ推定を上回っている。
さらに、SUPINNは生理的に可塑性で空間的に滑らかなCBFとATマップを生成する。
本研究は,乳児の雑音および限られたASLデータから精度の高い多パラメータ灌流推定のためのPINNの修正に成功したことを示す。
SUPINNのようなフレームワークは、複雑な心脳ネットワーク生理学の理解を深め、病気の検出と管理を支援する可能性がある。
ソースコードは、https://github.com/cgalaz01/supinn.comで提供されている。
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