論文の概要: log-RRIM: Yield Prediction via Local-to-global Reaction Representation Learning and Interaction Modeling

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.03320v1
• Date: Sun, 20 Oct 2024 18:35:56 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2024-11-10 12:31:17.656415
• Title: log-RRIM: Yield Prediction via Local-to-global Reaction Representation Learning and Interaction Modeling
• Title（参考訳）: log-RRIM: 局所-グローバル反応表現学習と相互作用モデリングによる収率予測
• Authors: Xiao Hu, Ziqi Chen, Daniel Adu-Ampratwum, Bo Peng, Xia Ning,
• Abstract要約: log-RRIMは、化学反応の収量を予測するために設計された革新的なグラフトランスフォーマーベースのフレームワークである。 本手法は,一意の局所的-グローバル的反応表現学習戦略を実装している。 反応剤-試薬相互作用の高度なモデリングと小さな分子断片への感受性により、化学合成における反応計画と最適化のための貴重なツールとなる。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 6.310759215182946
• License:
• Abstract: Accurate prediction of chemical reaction yields is crucial for optimizing organic synthesis, potentially reducing time and resources spent on experimentation. With the rise of artificial intelligence (AI), there is growing interest in leveraging AI-based methods to accelerate yield predictions without conducting in vitro experiments. We present log-RRIM, an innovative graph transformer-based framework designed for predicting chemical reaction yields. Our approach implements a unique local-to-global reaction representation learning strategy. This approach initially captures detailed molecule-level information and then models and aggregates intermolecular interactions, ensuring that the impact of varying-sizes molecular fragments on yield is accurately accounted for. Another key feature of log-RRIM is its integration of a cross-attention mechanism that focuses on the interplay between reagents and reaction centers. This design reflects a fundamental principle in chemical reactions: the crucial role of reagents in influencing bond-breaking and formation processes, which ultimately affect reaction yields. log-RRIM outperforms existing methods in our experiments, especially for medium to high-yielding reactions, proving its reliability as a predictor. Its advanced modeling of reactant-reagent interactions and sensitivity to small molecular fragments make it a valuable tool for reaction planning and optimization in chemical synthesis. The data and codes of log-RRIM are accessible through https://github.com/ninglab/Yield_log_RRIM.
• Abstract（参考訳）: 化学反応生成物の正確な予測は有機合成の最適化に不可欠であり、実験に費やされる時間と資源を減らす可能性がある。 人工知能(AI)の台頭に伴い、AIベースの手法を活用して、in vitro実験を行わずに収量予測を加速することへの関心が高まっている。 化学反応の収量を予測するために設計された,革新的なグラフトランスフォーマーベースのフレームワークであるlog-RRIMを提案する。 本手法は,一意の局所的-グローバル的反応表現学習戦略を実装している。 このアプローチは最初、詳細な分子レベルの情報をキャプチャし、次に分子間相互作用をモデル化し、集約し、様々な大きさの分子断片が収量に与える影響を正確に説明する。 log-RRIMのもう1つの重要な特徴は、試薬と反応中心の相互作用に焦点を当てたクロスアテンション機構の統合である。 この設計は化学反応の基本的な原理を反映しており、反応の収量に影響を与える結合破壊および形成過程における試薬の重要な役割を反映している。 log-RRIMは実験において既存の手法よりも優れており、特に中～高収率反応では予測器としての信頼性が証明されている。 反応剤-試薬相互作用の高度なモデリングと小さな分子断片への感受性により、化学合成における反応計画と最適化のための貴重なツールとなる。 log-RRIMのデータとコードはhttps://github.com/ninglab/Yield_log_RRIMからアクセスできる。

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