論文の概要: Look a Group at Once: Multi-Slide Modeling for Survival Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.11487v1
- Date: Mon, 18 Nov 2024 11:48:45 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-19 14:32:53.193943
- Title: Look a Group at Once: Multi-Slide Modeling for Survival Prediction
- Title(参考訳): グループを一度に見る: 生存予測のためのマルチスライダーモデリング
- Authors: Xinyang Li, Yi Zhang, Yi Xie, Jianfei Yang, Xi Wang, Hao Chen, Haixian Zhang,
- Abstract要約: GroupMILは、集団分析の臨床的実践に触発された新しいフレームワークである。
GPAMambaは、スライディングとインタースライディングの相互作用を促進するために設計されたモデルである。
我々のモデルはThe Cancer Genome Atlasの5つのデータセットで最先端のアプローチを大幅に上回っている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 20.81241745529587
- License:
- Abstract: Survival prediction is a critical task in pathology. In clinical practice, pathologists often examine multiple cases, leveraging a broader spectrum of cancer phenotypes to enhance pathological assessment. Despite significant advancements in deep learning, current solutions typically model each slide as a sample, struggling to effectively capture comparable and slide-agnostic pathological features. In this paper, we introduce GroupMIL, a novel framework inspired by the clinical practice of collective analysis, which models multiple slides as a single sample and organizes groups of patches and slides sequentially to capture cross-slide prognostic features. We also present GPAMamba, a model designed to facilitate intra- and inter-slide feature interactions, effectively capturing local micro-environmental characteristics within slide-level graphs while uncovering essential prognostic patterns across an extended patch sequence within the group framework. Furthermore, we develop a dual-head predictor that delivers comprehensive survival risk and probability assessments for each patient. Extensive empirical evaluations demonstrate that our model significantly outperforms state-of-the-art approaches across five datasets from The Cancer Genome Atlas.
- Abstract(参考訳): 生存予測は病理学における重要な課題である。
臨床実践において、病理学者はしばしば複数の症例を検査し、より広い範囲のがん表現型を活用して病理学的評価を高める。
ディープラーニングの大幅な進歩にもかかわらず、現在のソリューションは通常、各スライドをサンプルとしてモデル化し、同等でスライドに依存しない病理学的特徴を効果的に捉えるのに苦労している。
本稿では,複数のスライドを単一サンプルとしてモデル化し,パッチやスライドのグループを順次整理し,クロススライディングの予測的特徴を捉えるという,集団解析の臨床的実践に触発された新しいフレームワークであるGroupMILを紹介する。
また、GPAMambaは、スライドレベルグラフ内の局所的な微小環境特性を効果的に把握し、グループフレームワーク内の拡張パッチシーケンスにまたがる必須のパターンを明らかにする。
さらに,各患者に対して総合的生存リスクと確率アセスメントを提供するデュアルヘッド予測器を開発した。
The Cancer Genome Atlasの5つのデータセットにまたがって、我々のモデルは最先端のアプローチを大きく上回っている。
関連論文リスト
- Self-Contrastive Weakly Supervised Learning Framework for Prognostic Prediction Using Whole Slide Images [3.6330373579181927]
予測は、基底の真理ラベルが本質的に弱いため、独特な挑戦となる。
そこで本研究では, ネットワークを用いた組織分割アルゴリズムを用いて, 関心領域の抽出を行う新しい3部フレームワークを提案する。
AUCは再発率0.721, 再発率0.678, 治療成績予測は0.678であった。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-05-24T06:45:36Z) - Advancing Head and Neck Cancer Survival Prediction via Multi-Label Learning and Deep Model Interpretation [7.698783025721071]
我々は,複数のHNC生存率を同時に予測するための,解釈可能なマルチラベル・マルチモーダル・ディープ・サバイバル予測フレームワーク IMLSP を提案する。
また、深層生存モデル視覚説明のために開発された、グラディエント重み付き時間イベント活性化マッピング手法であるGrad-TEAMを提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-05-09T01:30:04Z) - Seeing Unseen: Discover Novel Biomedical Concepts via
Geometry-Constrained Probabilistic Modeling [53.7117640028211]
同定された問題を解決するために,幾何制約付き確率的モデリング処理を提案する。
構成された埋め込み空間のレイアウトに適切な制約を課すために、重要な幾何学的性質のスイートを組み込む。
スペクトルグラフ理論法は、潜在的な新規クラスの数を推定するために考案された。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-03-02T00:56:05Z) - Pathology-and-genomics Multimodal Transformer for Survival Outcome
Prediction [43.1748594898772]
大腸癌生存予測に病理学とゲノム学的知見を統合したマルチモーダルトランスフォーマー(PathOmics)を提案する。
ギガピクセル全スライド画像における組織ミクロ環境間の内在的相互作用を捉えるための教師なし事前訓練を強調した。
我々は,TCGA大腸癌と直腸癌コホートの両方に対するアプローチを評価し,提案手法は競争力があり,最先端の研究より優れていることを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-07-22T00:59:26Z) - Ambiguous Medical Image Segmentation using Diffusion Models [60.378180265885945]
我々は,グループ洞察の分布を学習することで,複数の可算出力を生成する単一拡散モデルに基づくアプローチを提案する。
提案モデルでは,拡散の固有のサンプリングプロセスを利用してセグメンテーションマスクの分布を生成する。
その結果,提案手法は既存の最先端曖昧なセグメンテーションネットワークよりも優れていることがわかった。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-04-10T17:58:22Z) - T-Phenotype: Discovering Phenotypes of Predictive Temporal Patterns in
Disease Progression [82.85825388788567]
我々は、ラベル付き時系列データから予測時相パターンの表現型を発見するために、新しい時間的クラスタリング手法T-Phenotypeを開発した。
T-フェノタイプは, 評価ベースラインのすべてに対して, 最良の表現型発見性能を示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-02-24T13:30:35Z) - EPIC-Survival: End-to-end Part Inferred Clustering for Survival
Analysis, Featuring Prognostic Stratification Boosting [0.0]
epic-survival bridgeは、エンドツーエンドサバイバルモデリングアプローチにエンコードし、集約する。
肝内胆管癌のモデルとしてEPIC-Survivalが有用であった。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-01-26T21:11:45Z) - Select-ProtoNet: Learning to Select for Few-Shot Disease Subtype
Prediction [55.94378672172967]
本研究は, 類似患者のサブグループを同定し, 数発の疾患のサブタイプ予測問題に焦点を当てた。
新しいモデルを開発するためにメタラーニング技術を導入し、関連する臨床課題から共通の経験や知識を抽出する。
我々の新しいモデルは、単純だが効果的なメタ学習マシンであるPrototypeal Networkと呼ばれる、慎重に設計されたメタラーナーに基づいて構築されている。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-09-02T02:50:30Z) - Divide-and-Rule: Self-Supervised Learning for Survival Analysis in
Colorectal Cancer [9.431791041887957]
本稿では,組織領域の表現とクラスタリングのメトリクスを学習し,その基盤となるパターンを学習する自己教師型学習手法を提案する。
提案手法は, 患者結果予測の過度な適合を避けるために, 線形予測器の恩恵を受けることができることを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-07-07T09:15:36Z) - Temporal Phenotyping using Deep Predictive Clustering of Disease
Progression [97.88605060346455]
我々は、時系列データをクラスタリングするためのディープラーニングアプローチを開発し、各クラスタは、同様の将来的な結果を共有する患者から構成される。
2つの実世界のデータセットに対する実験により、我々のモデルは最先端のベンチマークよりも優れたクラスタリング性能が得られることが示された。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-06-15T20:48:43Z) - Weakly supervised multiple instance learning histopathological tumor
segmentation [51.085268272912415]
スライド画像全体のセグメント化のための弱教師付きフレームワークを提案する。
トレーニングモデルに複数のインスタンス学習スキームを利用する。
提案するフレームワークは,The Cancer Genome AtlasとPatchCamelyonデータセットのマルチロケーションとマルチ中心公開データに基づいて評価されている。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-04-10T13:12:47Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。