論文の概要: Look a Group at Once: Multi-Slide Modeling for Survival Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.11487v2
- Date: Sun, 24 Nov 2024 04:23:45 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-26 14:15:09.389715
- Title: Look a Group at Once: Multi-Slide Modeling for Survival Prediction
- Title(参考訳): グループを一度に見る: 生存予測のためのマルチスライダーモデリング
- Authors: Xinyang Li, Yi Zhang, Yi Xie, Jianfei Yang, Xi Wang, Hao Chen, Haixian Zhang,
- Abstract要約: GroupMILは、集団分析の臨床的実践に触発された新しいフレームワークである。
GPAMambaは、スライディングとインタースライディングの相互作用を促進するために設計されたモデルである。
我々のモデルはThe Cancer Genome Atlasの5つのデータセットで最先端のアプローチを大幅に上回っている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 20.81241745529587
- License:
- Abstract: Survival prediction is a critical task in pathology. In clinical practice, pathologists often examine multiple cases, leveraging a broader spectrum of cancer phenotypes to enhance pathological assessment. Despite significant advancements in deep learning, current solutions typically model each slide as a sample, struggling to effectively capture comparable and slide-agnostic pathological features. In this paper, we introduce GroupMIL, a novel framework inspired by the clinical practice of collective analysis, which models multiple slides as a single sample and organizes groups of patches and slides sequentially to capture cross-slide prognostic features. We also present GPAMamba, a model designed to facilitate intra- and inter-slide feature interactions, effectively capturing local micro-environmental characteristics within slide-level graphs while uncovering essential prognostic patterns across an extended patch sequence within the group framework. Furthermore, we develop a dual-head predictor that delivers comprehensive survival risk and probability assessments for each patient. Extensive empirical evaluations demonstrate that our model significantly outperforms state-of-the-art approaches across five datasets from The Cancer Genome Atlas.
- Abstract(参考訳): 生存予測は病理学における重要な課題である。
臨床実践において、病理学者はしばしば複数の症例を検査し、より広い範囲のがん表現型を活用して病理学的評価を高める。
ディープラーニングの大幅な進歩にもかかわらず、現在のソリューションは通常、各スライドをサンプルとしてモデル化し、同等でスライドに依存しない病理学的特徴を効果的に捉えるのに苦労している。
本稿では,複数のスライドを単一サンプルとしてモデル化し,パッチやスライドのグループを順次整理し,クロススライディングの予測的特徴を捉えるという,集団解析の臨床的実践に触発された新しいフレームワークであるGroupMILを紹介する。
また、GPAMambaは、スライドレベルグラフ内の局所的な微小環境特性を効果的に把握し、グループフレームワーク内の拡張パッチシーケンスにまたがる必須のパターンを明らかにする。
さらに,各患者に対して総合的生存リスクと確率アセスメントを提供するデュアルヘッド予測器を開発した。
The Cancer Genome Atlasの5つのデータセットにまたがって、我々のモデルは最先端のアプローチを大きく上回っている。
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