論文の概要: DVasMesh: Deep Structured Mesh Reconstruction from Vascular Images for Dynamics Modeling of Vessels
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.00840v1
- Date: Sun, 01 Dec 2024 15:05:28 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-04 15:42:44.931039
- Title: DVasMesh: Deep Structured Mesh Reconstruction from Vascular Images for Dynamics Modeling of Vessels
- Title(参考訳): DVasMesh: 血管のダイナミクスモデリングのための血管画像からの深部構造メッシュ再構築
- Authors: Dengqiang Jia, Xinnian Yang, Xiaosong Xiong, Shijie Huang, Feiyu Hou, Li Qin, Kaicong Sun, Kannie Wai Yan Chan, Dinggang Shen,
- Abstract要約: 血管動態シミュレーションは、幾何学と血管疾患の進行との関係を研究する上で不可欠である。信頼性の高い力学シミュレーションは、高品質な血管メッシュに依存している。
既存のメッシュ生成メソッドのほとんどは手作業によるアノテーションに大きく依存しています。
そこで本研究では,DVasMeshと呼ばれる深層学習に基づく血管画像からヘキサヘドラルな血管メッシュを直接生成する手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 33.69621458523397
- License:
- Abstract: Vessel dynamics simulation is vital in studying the relationship between geometry and vascular disease progression. Reliable dynamics simulation relies on high-quality vascular meshes. Most of the existing mesh generation methods highly depend on manual annotation, which is time-consuming and laborious, usually facing challenges such as branch merging and vessel disconnection. This will hinder vessel dynamics simulation, especially for the population study. To address this issue, we propose a deep learning-based method, dubbed as DVasMesh to directly generate structured hexahedral vascular meshes from vascular images. Our contributions are threefold. First, we propose to formally formulate each vertex of the vascular graph by a four-element vector, including coordinates of the centerline point and the radius. Second, a vectorized graph template is employed to guide DVasMesh to estimate the vascular graph. Specifically, we introduce a sampling operator, which samples the extracted features of the vascular image (by a segmentation network) according to the vertices in the template graph. Third, we employ a graph convolution network (GCN) and take the sampled features as nodes to estimate the deformation between vertices of the template graph and target graph, and the deformed graph template is used to build the mesh. Taking advantage of end-to-end learning and discarding direct dependency on annotated labels, our DVasMesh demonstrates outstanding performance in generating structured vascular meshes on cardiac and cerebral vascular images. It shows great potential for clinical applications by reducing mesh generation time from 2 hours (manual) to 30 seconds (automatic).
- Abstract(参考訳): 血管動態シミュレーションは、幾何学と血管疾患の進行との関係を研究する上で不可欠である。
信頼性のある力学シミュレーションは高品質な血管メッシュに依存している。
既存のメッシュ生成メソッドの多くは、時間と労力を要する手動アノテーションに大きく依存しており、通常はブランチマージや血管切断といった課題に直面している。
これにより、特に人口調査において、容器力学のシミュレーションが妨げられる。
そこで本研究では,DVasMeshと呼ばれる深層学習に基づく,血管画像から構造化ヘキサヘドラル血管メッシュを直接生成する手法を提案する。
私たちの貢献は3倍です。
まず,中心点と半径の座標を含む4要素ベクトルを用いて,血管グラフの各頂点を公式に定式化することを提案する。
次に、ベクトル化グラフテンプレートを使用してDVasMeshを誘導し、血管グラフを推定する。
具体的には,テンプレートグラフの頂点に従って,血管画像の特徴を抽出するサンプリング演算子(セグメンテーションネットワーク)を提案する。
第3に、グラフ畳み込みネットワーク(GCN)を用いて、サンプル特徴をノードとして、テンプレートグラフとターゲットグラフの頂点間の変形を推定し、デフォルメグラフテンプレートを用いてメッシュを構築する。
我々のDVasMeshは、エンドツーエンドの学習とアノテートラベルへの直接的な依存を活かして、心血管画像と脳血管画像に構築された血管メッシュを生成する際、優れた性能を示す。
メッシュ生成時間を2時間(手動)から30秒(自動)に短縮することで、臨床応用に大きな可能性を示す。
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