論文の概要: Leveraging Weak Supervision for Cell Localization in Digital Pathology Using Multitask Learning and Consistency Loss
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.15392v1
- Date: Thu, 19 Dec 2024 20:45:29 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-23 16:23:02.393470
- Title: Leveraging Weak Supervision for Cell Localization in Digital Pathology Using Multitask Learning and Consistency Loss
- Title(参考訳): マルチタスク学習と一貫性損失を用いたデジタル病理組織における細胞局在推定の活用
- Authors: Berke Levent Cesur, Ayse Humeyra Dur Karasayar, Pinar Bulutay, Nilgun Kapucuoglu, Cisel Aydin Mericoz, Handan Eren, Omer Faruk Dilbaz, Javidan Osmanli, Burhan Soner Yetkili, Ibrahim Kulac, Can Fahrettin Koyuncu, Cigdem Gunduz-Demir,
- Abstract要約: 本研究は,デジタル病理学におけるマルチタスクネットワークのトレーニングのための混合スーパービジョン手法を提案する。
眼球形成過程に由来する細胞数、つまり病理学者がよく使う迅速な視覚的推定法が組み込まれている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.0889985982651806
- License:
- Abstract: Cell detection and segmentation are integral parts of automated systems in digital pathology. Encoder-decoder networks have emerged as a promising solution for these tasks. However, training of these networks has typically required full boundary annotations of cells, which are labor-intensive and difficult to obtain on a large scale. However, in many applications, such as cell counting, weaker forms of annotations--such as point annotations or approximate cell counts--can provide sufficient supervision for training. This study proposes a new mixed-supervision approach for training multitask networks in digital pathology by incorporating cell counts derived from the eyeballing process--a quick visual estimation method commonly used by pathologists. This study has two main contributions: (1) It proposes a mixed-supervision strategy for digital pathology that utilizes cell counts obtained by eyeballing as an auxiliary supervisory signal to train a multitask network for the first time. (2) This multitask network is designed to concurrently learn the tasks of cell counting and cell localization, and this study introduces a consistency loss that regularizes training by penalizing inconsistencies between the predictions of these two tasks. Our experiments on two datasets of hematoxylin-eosin stained tissue images demonstrate that the proposed approach effectively utilizes the weakest form of annotation, improving performance when stronger annotations are limited. These results highlight the potential of integrating eyeballing-derived ground truths into the network training, reducing the need for resource-intensive annotations.
- Abstract(参考訳): 細胞検出とセグメンテーションは、デジタル病理における自動システムの不可欠な部分である。
エンコーダとデコーダのネットワークは,これらのタスクに対して有望なソリューションとして登場した。
しかしながら、これらのネットワークのトレーニングは通常、労働集約的で大規模な取得が困難である細胞の完全な境界アノテーションを必要とする。
しかし、セルカウントのような多くのアプリケーションでは、ポイントアノテーションや近似セルカウントのような弱い形式のアノテーションがトレーニングに十分な監督を提供する。
本研究は,眼球形成過程から得られた細胞数を組み込むことで,デジタル病理学におけるマルチタスクネットワークのトレーニングを行うための新しい混合スーパービジョン手法を提案する。
本研究は,1)眼球運動によって得られた細胞数を補助的補助信号として利用し,初めてマルチタスクネットワークを訓練するデジタル病理学の混合スーパービジョン戦略を提案する。
2) このマルチタスクネットワークは,セルカウントとセルローカライゼーションのタスクを同時に学習するために設計されており,この2つのタスクの予測の不整合を解消し,トレーニングを規則化する一貫性損失を導入する。
ヘマトキシリン-エオシン染色組織像の2つのデータセットに対する実験により,本手法は最も弱いアノテーション形式を効果的に利用し,より強いアノテーションが制限された場合に性能を向上させることができることを示した。
これらの結果から,眼球由来の真理をネットワークトレーニングに統合し,リソース集約アノテーションの必要性を低減できる可能性が示唆された。
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