論文の概要: RepSNet: A Nucleus Instance Segmentation model based on Boundary Regression and Structural Re-parameterization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.05073v1
- Date: Thu, 08 May 2025 09:08:58 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-09 21:43:49.820676
- Title: RepSNet: A Nucleus Instance Segmentation model based on Boundary Regression and Structural Re-parameterization
- Title(参考訳): RepSNet:境界回帰と構造的再パラメータ化に基づく核インスタンスセグメンテーションモデル
- Authors: Shengchun Xiong, Xiangru Li, Yunpeng Zhong, Wanfen Peng,
- Abstract要約: 核のインスタンスセグメンテーションは、デジタル病理解析と病理診断において重要なステップである。
本稿では、核境界回帰に基づくニューラルネットワークモデルRepSNetを設計する。
RepSNetは、様々なスケールの受容場から特徴を集約するだけでなく、モデル推論フェーズにおけるパラメータ量と計算負担を削減することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Pathological diagnosis is the gold standard for tumor diagnosis, and nucleus instance segmentation is a key step in digital pathology analysis and pathological diagnosis. However, the computational efficiency of the model and the treatment of overlapping targets are the major challenges in the studies of this problem. To this end, a neural network model RepSNet was designed based on a nucleus boundary regression and a structural re-parameterization scheme for segmenting and classifying the nuclei in H\&E-stained histopathological images. First, RepSNet estimates the boundary position information (BPI) of the parent nucleus for each pixel. The BPI estimation incorporates the local information of the pixel and the contextual information of the parent nucleus. Then, the nucleus boundary is estimated by aggregating the BPIs from a series of pixels using a proposed boundary voting mechanism (BVM), and the instance segmentation results are computed from the estimated nucleus boundary using a connected component analysis procedure. The BVM intrinsically achieves a kind of synergistic belief enhancement among the BPIs from various pixels. Therefore, different from the methods available in literature that obtain nucleus boundaries based on a direct pixel recognition scheme, RepSNet computes its boundary decisions based on some guidances from macroscopic information using an integration mechanism. In addition, RepSNet employs a re-parametrizable encoder-decoder structure. This model can not only aggregate features from some receptive fields with various scales which helps segmentation accuracy improvement, but also reduce the parameter amount and computational burdens in the model inference phase through the structural re-parameterization technique. Extensive experiments demonstrated the superiorities of RepSNet compared to several typical benchmark models.
- Abstract(参考訳): 病理診断は腫瘍診断における金の標準であり,核のインスタンスセグメンテーションはデジタル病理解析と病理診断における重要なステップである。
しかし、モデルの計算効率と重なり合う対象の処理は、この問題の研究において大きな課題である。
この目的のために、ニューラルネットワークモデルRepSNetは、核境界回帰と構造的再パラメータ化スキームに基づいて、H\&E染色された病理像の核の分画と分類を設計した。
まず、RepSNetは、各画素の親核の境界位置情報(BPI)を推定する。
BPI推定は、画素の局所情報と親核の文脈情報を含む。
そして、提案した境界投票機構(BVM)を用いて一連の画素からBPIを集約して核境界を推定し、接続された成分分析手順を用いて推定された核境界からインスタンスセグメンテーション結果を算出する。
BVMは本質的に、様々な画素からBPI間の相乗的信念の強化を達成している。
そのため、RepSNetは、直接画素認識方式に基づいて核境界を求める文献で利用可能な手法とは違い、積分機構を用いたマクロ情報からのガイダンスに基づいて境界決定を計算する。
さらにRepSNetは再並列化可能なエンコーダデコーダ構造を採用している。
このモデルは, セグメンテーション精度の向上を支援する様々なスケールの受容場からの特徴を集約するだけでなく, 構造的再パラメータ化手法により, モデル推論フェーズにおけるパラメータ量と計算負担を低減することができる。
大規模な実験は、いくつかの典型的なベンチマークモデルと比較してRepSNetの優位性を実証した。
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