論文の概要: Auto-nnU-Net: Towards Automated Medical Image Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.16561v1
- Date: Thu, 22 May 2025 11:52:16 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-23 17:12:48.262663
- Title: Auto-nnU-Net: Towards Automated Medical Image Segmentation
- Title(参考訳): Auto-nU-Net:医療画像の自動分割に向けて
- Authors: Jannis Becktepe, Leona Hennig, Steffen Oeltze-Jafra, Marius Lindauer,
- Abstract要約: Medical Image Decathlon (MIS) には骨から臓器へのセグメンテーションまで様々なタスクが含まれており、それぞれに最適なセグメンテーションモデルを見つけるための独自の課題がある。
最先端のAutoML関連MIS-framework nnU-Netはモデル構成の多くの側面を自動化する。
本稿では,ハイパーパラメータ最適化(HPO),ニューラルアーキテクチャ探索(NAS),階層型NASを実現する新しいnnU-Net変種であるAutonnU-Netを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.342326020477723
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Medical Image Segmentation (MIS) includes diverse tasks, from bone to organ segmentation, each with its own challenges in finding the best segmentation model. The state-of-the-art AutoML-related MIS-framework nnU-Net automates many aspects of model configuration but remains constrained by fixed hyperparameters and heuristic design choices. As a full-AutoML framework for MIS, we propose Auto-nnU-Net, a novel nnU-Net variant enabling hyperparameter optimization (HPO), neural architecture search (NAS), and hierarchical NAS (HNAS). Additionally, we propose Regularized PriorBand to balance model accuracy with the computational resources required for training, addressing the resource constraints often faced in real-world medical settings that limit the feasibility of extensive training procedures. We evaluate our approach across diverse MIS datasets from the well-established Medical Segmentation Decathlon, analyzing the impact of AutoML techniques on segmentation performance, computational efficiency, and model design choices. The results demonstrate that our AutoML approach substantially improves the segmentation performance of nnU-Net on 6 out of 10 datasets and is on par on the other datasets while maintaining practical resource requirements. Our code is available at https://github.com/LUH-AI/AutonnUNet.
- Abstract(参考訳): 医用画像セグメンテーション(MIS)には骨から臓器セグメンテーションまで多様なタスクが含まれており、それぞれに最適なセグメンテーションモデルを見つけるための独自の課題がある。
最先端のAutoML関連のMIS-framework nnU-Netはモデル構成の多くの側面を自動化するが、固定されたハイパーパラメータとヒューリスティックな設計選択によって制約されている。
MISのためのフルオートMLフレームワークとして、ハイパーパラメータ最適化(HPO)、ニューラルアーキテクチャサーチ(NAS)、階層NAS(HNAS)を実現する新しいnnU-Net変種であるAuto-nnU-Netを提案する。
さらに、トレーニングに必要な計算資源とモデルの精度をバランスさせ、広範囲なトレーニング手順の実現可能性を制限する現実世界の医療環境において直面するリソース制約に対処する。
我々は、確立されたメディカルセグメンテーション宣言から様々なMISデータセットにまたがるアプローチを評価し、AutoML技術がセグメンテーション性能、計算効率、モデル設計選択に与える影響を分析した。
その結果、我々のAutoMLアプローチは10データセット中6データセットでのnnU-Netのセグメンテーション性能を大幅に改善し、実用的なリソース要件を維持しつつ、他のデータセットと同等であることがわかった。
私たちのコードはhttps://github.com/LUH-AI/AutonnUNet.comで公開されています。
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