論文の概要: SOC-DGL: Social Interaction Behavior Inspired Dual Graph Learning Framework for Drug-Target Interaction Identification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.01405v1
- Date: Mon, 02 Jun 2025 08:00:24 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-04 21:47:34.097155
- Title: SOC-DGL: Social Interaction Behavior Inspired Dual Graph Learning Framework for Drug-Target Interaction Identification
- Title(参考訳): SOC-DGL:ドラッグターゲット相互作用識別のためのデュアルグラフ学習フレームワーク
- Authors: Xiang Zhao, Ruijie Li, Qiao Ning, Shikai Guo, Hui Li, Qian Ma,
- Abstract要約: 本稿では, Affinity-Driven Graph Learning (ADGL) モジュールと Equilibrium-Driven Graph Learning (EDGL) モジュールの2つの特別なモジュールからなるSOC-DGLを提案する。
ADGLモジュールは、親和性を高めたグローバルなドラッグターゲットグラフを利用して、グローバルなDTIと、ドラッグとターゲットの個人的類似情報の両方を学ぶ、包括的なソーシャルインタラクション戦略を採用している。
EDGLモジュールは高階の社会的相互作用戦略を採用し、バランス理論に基づく偶数多項式グラフフィルタによって偶数ホップの隣人の影響を増幅する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.776003706755337
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The identification of drug-target interactions (DTI) is crucial for drug discovery and repositioning, as it reveals potential uses of existing drugs, aiding in the acceleration of the drug development process and reducing associated costs. Despite the similarity information in DTI is important, most models are limited to mining direct similarity information within homogeneous graphs, overlooking the potential yet rich similarity information in heterogeneous graphs. Inspired by real-world social interaction behaviors, we propose SOC-DGL, which comprises two specialized modules: the Affinity-Driven Graph Learning (ADGL) module and the Equilibrium-Driven Graph Learning (EDGL) module. The ADGL module adopts a comprehensive social interaction strategy, leveraging an affinity-enhanced global drug-target graph to learn both global DTI and the individual similarity information of drugs and targets. In contrast, the EDGL module employs a higher-order social interaction strategy, amplifying the influence of even-hop neighbors through an even-polynomial graph filter grounded in balance theory, enabling the indirect mining of higher-order homogeneous information. This dual approach enables SOC-DGL to effectively and comprehensively capture similarity information across diverse interaction scales within the affinity matrices and drug-target association matrices, significantly enhancing the model's generalization capability and predictive accuracy in DTI tasks. To address the issue of imbalance in drug-target interaction datasets, this paper proposes an adjustable imbalance loss function that mitigates the impact of sample imbalance by adjusting the weight of negative samples and a parameter. Extensive experiments on four benchmark datasets demonstrate significant accuracy improvements achieved by SOC-DGL, particularly in scenarios involving data imbalance and unseen drugs or targets.
- Abstract(参考訳): 薬物と標的の相互作用(DTI)の同定は、薬物の発見と再配置に不可欠であり、既存の薬物の使用の可能性を明らかにし、薬物開発プロセスの加速と関連するコストの削減に寄与する。
DTIにおける類似性情報は重要であるが、ほとんどのモデルは同質グラフ内の直接類似性情報をマイニングすることに限定され、不均一グラフにおける潜在的にリッチな類似性情報を見渡すことができる。
SOC-DGLはAffinity-Driven Graph Learning(ADGL)モジュールとEquilibrium-Driven Graph Learning(EDGL)モジュールの2つの特殊なモジュールからなる。
ADGLモジュールは、親和性を高めたグローバルなドラッグターゲットグラフを利用して、グローバルなDTIと、ドラッグとターゲットの個人的類似情報の両方を学ぶ、包括的なソーシャルインタラクション戦略を採用している。
対照的に、EDGLモジュールは高階の社会的相互作用戦略を採用し、バランス理論に基づく偶数多項式グラフフィルタによって偶数ホップ近傍の影響を増幅し、高階の同質情報の間接的なマイニングを可能にする。
この2つのアプローチにより、SOC-DGLは親和性行列とドラッグターゲット関連行列内の様々な相互作用スケールの類似情報を効果的かつ包括的に取得し、DTIタスクにおけるモデルの一般化能力と予測精度を大幅に向上させることができる。
薬物-標的相互作用データセットにおける不均衡の問題に対処するために, 負のサンプルとパラメータの重みを調整して, 試料不均衡の影響を緩和する調整可能な不均衡損失関数を提案する。
4つのベンチマークデータセットに対する大規模な実験は、SOC-DGLによって達成された、特にデータ不均衡や目に見えない薬物や標的を含むシナリオにおいて、大幅な精度の向上を示す。
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