論文の概要: SOC-DGL: Social Interaction Behavior Inspired Dual Graph Learning Framework for Drug-Target Interaction Identification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.01405v2
- Date: Sun, 20 Jul 2025 11:33:18 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-22 18:47:38.931607
- Title: SOC-DGL: Social Interaction Behavior Inspired Dual Graph Learning Framework for Drug-Target Interaction Identification
- Title(参考訳): SOC-DGL:ドラッグターゲット相互作用識別のためのデュアルグラフ学習フレームワーク
- Authors: Xiang Zhao, Ruijie Li, Qiao Ning, Shikai Guo, Hui Li, Qian Ma,
- Abstract要約: SOC-DGLは親和性を持つ薬物標的グラフを用いてグローバルな類似性を学習する。
バランス理論に基づく偶数多項式グラフフィルタを用いて、偶数ホップ近傍の影響を増幅することにより、高次類似性を捉える。
SOC-DGLは、バランスのとれたシナリオと不均衡なシナリオの両方で、既存の最先端メソッドを一貫して上回っている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.776003706755337
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The identification of drug-target interactions (DTI) is critical for drug discovery and repositioning, as it reveals potential therapeutic uses of existing drugs, accelerating development and reducing costs. However, most existing models focus only on direct similarity in homogeneous graphs, failing to exploit the rich similarity in heterogeneous graphs. To address this gap, inspired by real-world social interaction behaviors, we propose SOC-DGL, which comprises two specialized modules: the Affinity-Driven Graph Learning (ADGL) module, learning global similarity through an affinity-enhanced drug-target graph, and the Equilibrium-Driven Graph Learning (EDGL) module, capturing higher-order similarity by amplifying the influence of even-hop neighbors using an even-polynomial graph filter based on balance theory. This dual approach enables SOC-DGL to effectively capture similarity information across multiple interaction scales within affinity and association matrices. To address the issue of imbalance in DTI datasets, we propose an adjustable imbalance loss function that adjusts the weight of negative samples by the parameter. Extensive experiments on four benchmark datasets demonstrate that SOC-DGL consistently outperforms existing state-of-the-art methods across both balanced and imbalanced scenarios. Moreover, SOC-DGL successfully predicts the top 9 drugs known to bind ABL1, and further analyzed the 10th drug, which has not been experimentally confirmed to interact with ABL1, providing supporting evidence for its potential binding.
- Abstract(参考訳): 薬物と標的の相互作用(DTI)の同定は、薬物の発見と再配置に重要である。
しかし、既存のほとんどのモデルは、同質グラフの直接類似性のみに焦点をあて、異質グラフのリッチ類似性を利用していない。
このギャップに対処するために、現実世界の社会的相互作用の振る舞いに着想を得たSOC-DGLを提案する。これは、親和性駆動グラフ学習(ADGL)モジュール、親和性強化ドラッグターゲットグラフによるグローバルな類似性学習、平衡理論に基づく偶数ホップグラフフィルタによる偶数ホップ近傍の影響を増幅して高次類似性を取得するEquilibrium-Driven Graph Learning(EDGL)モジュールである。
この二重アプローチにより、SOC-DGLは親和性および関連行列内の複数の相互作用スケールにおける類似情報を効果的に取得できる。
DTIデータセットにおける不均衡の問題に対処するため,パラメータによって負のサンプルの重みを調整する調整可能な不均衡損失関数を提案する。
4つのベンチマークデータセットに対する大規模な実験により、SOC-DGLは、バランスの取れたシナリオと不均衡なシナリオの両方で、既存の最先端メソッドを一貫して上回っていることが示された。
さらに、SOC-DGLはABL1と結合することが知られているトップ9の薬物を予測し、ABL1と相互作用することが実験的に確認されていない第10の薬物を解析し、その潜在的な結合の証拠を提供する。
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