論文の概要: Uncertainty-Aware Segmentation Quality Prediction via Deep Learning Bayesian Modeling: Comprehensive Evaluation and Interpretation on Skin Cancer and Liver Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.01460v1
- Date: Sat, 02 Aug 2025 18:30:32 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-05 18:25:21.888366
- Title: Uncertainty-Aware Segmentation Quality Prediction via Deep Learning Bayesian Modeling: Comprehensive Evaluation and Interpretation on Skin Cancer and Liver Segmentation
- Title(参考訳): 深層学習ベイズモデルによる未確認セグメンテーション品質予測:皮膚癌と肝セグメンテーションの包括的評価と解釈
- Authors: Sikha O K, Meritxell Riera-Marín, Adrian Galdran, Javier García Lopez, Julia Rodríguez-Comas, Gemma Piella, Miguel A. González Ballester,
- Abstract要約: そこで本研究では,テスト期間中に真理アノテーションを必要とせずにセグメンテーションの品質を予測できる新しいフレームワークを提案する。
我々のフレームワークは、HAM10000データセット上のR2スコア93.25とピアソン相関96.58を達成している。
3次元肝セグメンテーションでは、エントロピーによるテスト時間増強はR2スコア85.03、ピアソン相関65.02を達成し、モダリティ間の堅牢性を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.428446217085158
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Image segmentation is a critical step in computational biomedical image analysis, typically evaluated using metrics like the Dice coefficient during training and validation. However, in clinical settings without manual annotations, assessing segmentation quality becomes challenging, and models lacking reliability indicators face adoption barriers. To address this gap, we propose a novel framework for predicting segmentation quality without requiring ground truth annotations during test time. Our approach introduces two complementary frameworks: one leveraging predicted segmentation and uncertainty maps, and another integrating the original input image, uncertainty maps, and predicted segmentation maps. We present Bayesian adaptations of two benchmark segmentation models-SwinUNet and Feature Pyramid Network with ResNet50-using Monte Carlo Dropout, Ensemble, and Test Time Augmentation to quantify uncertainty. We evaluate four uncertainty estimates: confidence map, entropy, mutual information, and expected pairwise Kullback-Leibler divergence on 2D skin lesion and 3D liver segmentation datasets, analyzing their correlation with segmentation quality metrics. Our framework achieves an R2 score of 93.25 and Pearson correlation of 96.58 on the HAM10000 dataset, outperforming previous segmentation quality assessment methods. For 3D liver segmentation, Test Time Augmentation with entropy achieves an R2 score of 85.03 and a Pearson correlation of 65.02, demonstrating cross-modality robustness. Additionally, we propose an aggregation strategy that combines multiple uncertainty estimates into a single score per image, offering a more robust and comprehensive assessment of segmentation quality. Finally, we use Grad-CAM and UMAP-based embedding analysis to interpret the model's behavior and reliability, highlighting the impact of uncertainty integration.
- Abstract(参考訳): 画像セグメンテーション(英: image segmentation)は、コンピュータバイオメディカル画像解析において重要なステップであり、通常、トレーニングと検証の間、Dice係数のようなメトリクスを用いて評価される。
しかし,手動アノテーションを伴わない臨床環境では,セグメンテーションの品質評価が困難となり,信頼性指標が欠如しているモデルでは採用障壁に直面している。
このギャップに対処するために,テスト期間中に真理アノテーションを必要とせずにセグメンテーション品質を予測できる新しいフレームワークを提案する。
提案手法では,予測セグメンテーションと不確実性マップの活用と,元の入力画像,不確実性マップ,予測セグメンテーションマップの統合という2つの補完的枠組みを導入する。
本稿では,ResNet50を使用中のMonte Carlo Dropout,Ensemble,Test Time Augmentationの2つのベンチマークセグメンテーションモデルであるSwinUNetとFeature Pyramid Networkのベイズ適応について述べる。
信頼性マップ,エントロピー,相互情報,および2次元皮膚病変に対するKulback-Leibler偏差と3次元肝セグメンテーションデータセットの4つの不確実性評価を行い,セグメンテーション品質指標との相関を解析した。
本フレームワークは,HAM10000データセットにおけるR2スコア93.25とピアソン相関96.58を達成し,従来のセグメンテーション品質評価法よりも優れていた。
3次元肝セグメンテーションでは、エントロピーによるテスト時間増強はR2スコア85.03、ピアソン相関65.02を達成し、モダリティ間の堅牢性を示す。
さらに,複数の不確実性推定を画像毎の単一スコアに組み合わせ,より堅牢で包括的なセグメンテーション品質評価を行うアグリゲーション戦略を提案する。
最後に,Grad-CAM と UMAP に基づく埋め込み解析を用いてモデルの挙動と信頼性を解析し,不確実性統合の影響を明らかにする。
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