論文の概要: Tau-BNO: Brain Neural Operator for Tau Transport Model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.08108v2
- Date: Tue, 17 Mar 2026 01:49:20 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-18 13:19:43.65475
- Title: Tau-BNO: Brain Neural Operator for Tau Transport Model
- Title(参考訳): Tau-Bno: Tauトランスポートモデルのための脳神経オペレータ
- Authors: Nuutti Barron, Heng Rao, Urmi Saha, Yu Gu, Zhenghao Liu, Ge Yu, Defu Yang, Ashish Raj, Minghan Chen,
- Abstract要約: 既存のアプローチは通常、脳の構造的コネクトームの拡散過程としてタウ伝播をモデル化する。
このギャップを埋めるためにネットワークトランスポートモデル(NTM)が導入された。
我々は,NTM力学を高速に近似する脳神経オペレータ・サロゲートフレームワークであるTau-BNOを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.92108740721371
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Mechanistic modeling provides a biophysically grounded framework for studying the spread of pathological tau protein in tauopathies like Alzheimer's disease. Existing approaches typically model tau propagation as a diffusive process on the brain's structural connectome, reproducing macroscopic patterns but neglecting microscale cellular transport and reaction mechanisms. The Network Transport Model (NTM) was introduced to fill this gap, explaining how region-level progression of tau emerges from microscale biophysical processes. However, the NTM faces a common challenge for complex models defined by large systems of partial differential equations: the inability to perform parameter inference and mechanistic discovery due to high computational burden and slow model simulations. To overcome this barrier, we propose Tau-BNO, a Brain Neural Operator surrogate framework for rapidly approximating NTM dynamics that captures both intra-regional reaction kinetics and inter-regional network transport. Tau-BNO combines a function operator that encodes kinetic parameters with a query operator that preserves initial state information, while approximating anisotropic transport through a spectral kernel that retains directionality. Empirical evaluations demonstrate high predictive accuracy ($R^2\approx$ 0.98) across diverse biophysical regimes and an 89\% performance improvement over state-of-the-art sequence models like Transformers and Mamba, which lack inherent structural priors. By reducing simulation time from hours to seconds, we show that the surrogate model is capable of producing new insights and generating new hypotheses. This framework is readily extensible to a broader class of connectome-based biophysical models, showcasing the transformative value of deep learning surrogates to accelerate analysis of large-scale, computationally intensive dynamical systems.
- Abstract(参考訳): メカニスティック・モデリングは、アルツハイマー病のようなタウオパチーにおける病理学的タウタンパク質の拡散を研究するための、生物物理学的な基盤となる枠組みを提供する。
既存のアプローチは通常、脳の構造的コネクトームの拡散過程としてタウ伝播をモデル化し、マクロなパターンを再現するが、マイクロスケールの細胞輸送と反応機構を無視する。
このギャップを埋めるためにネットワークトランスポートモデル(NTM)が導入された。
しかし、NTMは偏微分方程式の大きな系で定義される複雑なモデルに対して共通の課題に直面している。
この障壁を克服するために、我々は、地域内反応速度と地域間ネットワーク輸送の両方をキャプチャするNTMダイナミクスを高速に近似するための脳神経オペレータ・サロゲートフレームワークであるTau-BNOを提案する。
Tau-BNOは、運動パラメータを符号化する関数演算子と初期状態情報を保存するクエリ演算子を結合し、指向性を保持するスペクトルカーネルを介して異方性輸送を近似する。
実験的な評価は、様々な生物物理体制において高い予測精度(R^2\approx$ 0.98)を示し、トランスフォーマーやマンバのような最先端のシークエンスモデルよりも89 %の性能向上を示した。
シミュレーション時間を数時間から秒に短縮することにより、代理モデルが新たな洞察を生み出し、新しい仮説を生成することができることを示す。
このフレームワークは、より広範なコネクトームベースの生体物理モデルに容易に拡張可能であり、大規模で計算集約的な力学系の解析を加速するために、ディープラーニングサロゲートの変換値を示す。
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